35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3097 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_3097  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  289  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190515 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3234  hypothetical protein  72.66 
 
 
153 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3396  hypothetical protein  72.66 
 
 
153 aa  213  9e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0306  hypothetical protein  72.66 
 
 
153 aa  213  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0108  hypothetical protein  72.66 
 
 
139 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0094  hypothetical protein  72.66 
 
 
139 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2242  hypothetical protein  72.66 
 
 
139 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2843  hypothetical protein  72.66 
 
 
139 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00444589  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6519  hypothetical protein  71.43 
 
 
143 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3180  hypothetical protein  70.59 
 
 
151 aa  204  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924144  normal  0.0155035 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3162  hypothetical protein  70.59 
 
 
151 aa  204  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139993  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2548  hypothetical protein  70.59 
 
 
151 aa  204  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0945722  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3214  hypothetical protein  71.11 
 
 
145 aa  203  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3098  hypothetical protein  71.11 
 
 
145 aa  203  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393467  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3153  hypothetical protein  69.12 
 
 
144 aa  203  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000729071 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3062  hypothetical protein  69.12 
 
 
141 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.758596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1292  hypothetical protein  69.12 
 
 
141 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2936  hypothetical protein  69.12 
 
 
141 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2250  hypothetical protein  67.65 
 
 
148 aa  186  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232002  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3985  hypothetical protein  63.97 
 
 
135 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4467  hypothetical protein  62.5 
 
 
135 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3549  hypothetical protein  68.18 
 
 
66 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4468  hypothetical protein  41.55 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1650  hypothetical protein  35.34 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0802  hypothetical protein  34.65 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24460  hypothetical protein  36.22 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2221  hypothetical protein  28.03 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.14627  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3246  hypothetical protein  34.62 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.643885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1511  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  34.21 
 
 
243 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  30.48 
 
 
243 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0643  hypothetical protein  41.18 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  32.1 
 
 
235 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1440  hypothetical protein  30.95 
 
 
148 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257852  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0642  hypothetical protein  32.61 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>