31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1511 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1511  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  268  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0802  hypothetical protein  50.38 
 
 		 140 aa  123  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24460  hypothetical protein  54.26 
 
 		 138 aa  120  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0643  hypothetical protein  42.42 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0642  hypothetical protein  43.44 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3246  hypothetical protein  42.97 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.643885  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2221  hypothetical protein  38.21 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.14627  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1085  hypothetical protein  38.33 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3097  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000190515 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1650  hypothetical protein  37.18 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4468  hypothetical protein  35.53 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  35.21 
 
 		 243 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 262 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3098  hypothetical protein  34.92 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393467  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 262 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3214  hypothetical protein  34.92 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3153  hypothetical protein  37.63 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000729071 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1440  hypothetical protein  29.41 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257852  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3162  hypothetical protein  32.31 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139993  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2548  hypothetical protein  32.31 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0945722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3180  hypothetical protein  32.31 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924144  normal  0.0155035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  32.43 
 
 		 243 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6519  hypothetical protein  36.67 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  35.53 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  46.67 
 
 		 293 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  30.77 
 
 		 338 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  35.59 
 
 		 262 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  35.59 
 
 		 262 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2936  hypothetical protein  28.26 
 
 		 141 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3062  hypothetical protein  28.26 
 
 		 141 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.758596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1292  hypothetical protein  28.26 
 
 		 141 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>