34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1650 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1650  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3153  hypothetical protein  39.1 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000729071 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2843  hypothetical protein  38.93 
 
 
139 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00444589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0108  hypothetical protein  38.93 
 
 
139 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554325  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2242  hypothetical protein  38.93 
 
 
139 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0094  hypothetical protein  38.93 
 
 
139 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3234  hypothetical protein  38.24 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0306  hypothetical protein  38.93 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3396  hypothetical protein  38.93 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635298  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3098  hypothetical protein  38.35 
 
 
145 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393467  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3214  hypothetical protein  38.35 
 
 
145 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6519  hypothetical protein  36.84 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3180  hypothetical protein  36.84 
 
 
151 aa  84.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924144  normal  0.0155035 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2548  hypothetical protein  36.84 
 
 
151 aa  84.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0945722  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3162  hypothetical protein  36.84 
 
 
151 aa  84.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139993  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2250  hypothetical protein  37.5 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232002  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1292  hypothetical protein  36.09 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2936  hypothetical protein  36.09 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3062  hypothetical protein  36.09 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.758596  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3097  hypothetical protein  35.34 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190515 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3985  hypothetical protein  36.92 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4467  hypothetical protein  37.69 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0802  hypothetical protein  37.59 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2221  hypothetical protein  33.07 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.14627  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24460  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4468  hypothetical protein  39.74 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3246  hypothetical protein  41.03 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.643885  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0642  hypothetical protein  30.11 
 
 
142 aa  50.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  37.5 
 
 
243 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1511  hypothetical protein  37.18 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  31.76 
 
 
243 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2645  hypothetical protein  30.3 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2773  hypothetical protein  30.3 
 
 
161 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1440  hypothetical protein  30.09 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>