32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3985 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3985  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  275  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4467  hypothetical protein  96.3 
 
 
135 aa  266  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3097  hypothetical protein  63.97 
 
 
140 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190515 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6519  hypothetical protein  60.43 
 
 
143 aa  169  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0306  hypothetical protein  60.87 
 
 
153 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3153  hypothetical protein  62.5 
 
 
144 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000729071 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3396  hypothetical protein  60.87 
 
 
153 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635298  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0108  hypothetical protein  60.87 
 
 
139 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0094  hypothetical protein  60.87 
 
 
139 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2242  hypothetical protein  60.87 
 
 
139 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3180  hypothetical protein  61.03 
 
 
151 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924144  normal  0.0155035 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2843  hypothetical protein  60.87 
 
 
139 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00444589  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2548  hypothetical protein  61.03 
 
 
151 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0945722  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3162  hypothetical protein  61.03 
 
 
151 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139993  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3098  hypothetical protein  62.96 
 
 
145 aa  167  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393467  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3214  hypothetical protein  62.96 
 
 
145 aa  167  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3234  hypothetical protein  60.87 
 
 
153 aa  166  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2250  hypothetical protein  61.03 
 
 
148 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232002  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1292  hypothetical protein  61.03 
 
 
141 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3062  hypothetical protein  61.03 
 
 
141 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.758596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2936  hypothetical protein  61.03 
 
 
141 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4468  hypothetical protein  45.65 
 
 
138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3549  hypothetical protein  58.06 
 
 
66 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1650  hypothetical protein  36.92 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2221  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.14627  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0802  hypothetical protein  33.59 
 
 
140 aa  60.5  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24460  hypothetical protein  35.16 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  35.8 
 
 
243 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  30.95 
 
 
243 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3246  hypothetical protein  38.67 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.643885  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1440  hypothetical protein  29.27 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257852  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0642  hypothetical protein  34.29 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>