34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3162 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_3180  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924144  normal  0.0155035 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3162  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139993  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2548  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0945722  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6519  hypothetical protein  93.75 
 
 
143 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3153  hypothetical protein  91.61 
 
 
144 aa  267  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000729071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3214  hypothetical protein  90.34 
 
 
145 aa  265  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3098  hypothetical protein  90.34 
 
 
145 aa  265  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393467  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3396  hypothetical protein  84.62 
 
 
153 aa  243  9e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0306  hypothetical protein  84.62 
 
 
153 aa  243  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3234  hypothetical protein  84.62 
 
 
153 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2843  hypothetical protein  85.29 
 
 
139 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00444589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0108  hypothetical protein  85.29 
 
 
139 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0094  hypothetical protein  85.29 
 
 
139 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2242  hypothetical protein  85.29 
 
 
139 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2250  hypothetical protein  75 
 
 
148 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232002  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1292  hypothetical protein  76.64 
 
 
141 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3062  hypothetical protein  76.64 
 
 
141 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.758596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2936  hypothetical protein  76.64 
 
 
141 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3097  hypothetical protein  70.59 
 
 
140 aa  204  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190515 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3985  hypothetical protein  61.03 
 
 
135 aa  168  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4467  hypothetical protein  59.56 
 
 
135 aa  164  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3549  hypothetical protein  80.95 
 
 
66 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1650  hypothetical protein  36.84 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4468  hypothetical protein  41.53 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0802  hypothetical protein  34.38 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2221  hypothetical protein  31.94 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.14627  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24460  hypothetical protein  41.56 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1440  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  36.14 
 
 
243 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3246  hypothetical protein  38.46 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.643885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  31.71 
 
 
243 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1511  hypothetical protein  32.31 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0643  hypothetical protein  34.29 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0642  hypothetical protein  45.45 
 
 
142 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>