176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0879 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0879  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 
115 aa  219  9.999999999999999e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0972  ATP synthase F0, C subunit  58.04 
 
 
114 aa  95.9  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.68709e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 
91 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  38.96 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  41.67 
 
 
82 aa  67.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  41.67 
 
 
82 aa  67.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  33.33 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  41.56 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 
81 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 
81 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 
81 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  40.28 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 
81 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  38.96 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  40.26 
 
 
88 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  39.13 
 
 
103 aa  62.8  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  49.06 
 
 
90 aa  62  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  46.03 
 
 
72 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  46.03 
 
 
72 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  46.03 
 
 
72 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  46.03 
 
 
72 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  46.03 
 
 
72 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  46.03 
 
 
72 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  46.03 
 
 
72 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  46.03 
 
 
72 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  46.03 
 
 
72 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  46.03 
 
 
72 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  46.03 
 
 
72 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  48.39 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  40.91 
 
 
321 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  40.68 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  36.59 
 
 
90 aa  57  0.0000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  48.33 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  46.3 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  43.4 
 
 
96 aa  57  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2067  ATP synthase F0, C subunit  40.68 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.107619 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  36.76 
 
 
93 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  35.71 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  43.06 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  39.73 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  35.29 
 
 
93 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2086  ATP synthase F0, C subunit  42.11 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000184566  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  49.12 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  50.91 
 
 
74 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1389  ATP synthase F0, C subunit  40.68 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  32.88 
 
 
95 aa  53.9  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  45 
 
 
76 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  36.07 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2701  ATP synthase F0, C subunit  39.62 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.025291  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  43.55 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  34.29 
 
 
93 aa  52  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  40.3 
 
 
76 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  40.3 
 
 
76 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  40.3 
 
 
76 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1201  ATP synthase F0 sector, C subunit  40.85 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 
83 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  35 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  40.98 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  40.98 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  40.98 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1014  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  39.44 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1166  F0F1 ATP synthase subunit C  31.43 
 
 
93 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214234  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  31.43 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0943  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  43.1 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  35.29 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0878  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00312668  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  35 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  35 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  34.62 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  40.32 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  35.71 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  40.62 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  33.33 
 
 
81 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  40.62 
 
 
78 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0128  F0F1 ATP synthase subunit C  37.5 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1051  F0F1 ATP synthase subunit C  37.5 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  35 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000022409  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  33.33 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0424  F0F1 ATP synthase subunit C  37.5 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  36.76 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  35.71 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1295  F0F1 ATP synthase subunit C  37.5 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490401  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2789  F0F1 ATP synthase subunit C  37.5 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2647  F0F1 ATP synthase subunit C  37.5 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0152  F0F1 ATP synthase subunit C  37.5 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0463692  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  40.91 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3101  F0F1 ATP synthase subunit C  31.67 
 
 
91 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00136484  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  35 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>