16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2210 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2210  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  817    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1588  hypothetical protein  35.66 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal  0.483169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1792  hypothetical protein  34.71 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2088  hypothetical protein  35.96 
 
 		 380 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00004808  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4248  hypothetical protein  28.65 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0344938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2055  hypothetical protein  29.07 
 
 		 390 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4352  hypothetical protein  24.87 
 
 		 521 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6930  hypothetical protein  23.4 
 
 		 525 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.927705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2346  hypothetical protein  23.91 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000237272  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0136  hypothetical protein  24.29 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2216  hypothetical protein  23.98 
 
 		 609 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.747974  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2181  hypothetical protein  30.56 
 
 		 270 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4002  hypothetical protein  30.1 
 
 		 262 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  0.555235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4168  hypothetical protein  33.64 
 
 		 276 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000709743  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3889  hypothetical protein  30.83 
 
 		 928 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2758  hypothetical protein  36.49 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932137  normal  0.130604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>