14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2181 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2181  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  558  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4002  hypothetical protein  36.8 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  0.555235 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2780  hypothetical protein  37.86 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000279313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4168  hypothetical protein  36.17 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000709743  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3889  hypothetical protein  40.22 
 
 		 928 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4409  hypothetical protein  34.65 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2758  hypothetical protein  37.97 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932137  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1792  hypothetical protein  27.73 
 
 		 384 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2210  hypothetical protein  30.56 
 
 		 394 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2088  hypothetical protein  28.93 
 
 		 380 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00004808  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1588  hypothetical protein  31.31 
 
 		 397 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal  0.483169 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4248  hypothetical protein  24.22 
 
 		 396 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0344938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1849  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1459 aa  42.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.873254  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4352  hypothetical protein  28.81 
 
 		 521 aa  42  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>