16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1588 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1588  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  810    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal  0.483169 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4248  hypothetical protein  39.43 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0344938  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2210  hypothetical protein  35.66 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1792  hypothetical protein  35.19 
 
 		 384 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2088  hypothetical protein  35.56 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00004808  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0136  hypothetical protein  27.53 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2346  hypothetical protein  27.09 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000237272  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2055  hypothetical protein  24.94 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4352  hypothetical protein  25.19 
 
 		 521 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6930  hypothetical protein  27.57 
 
 		 525 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.927705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2181  hypothetical protein  31.31 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4168  hypothetical protein  32.67 
 
 		 276 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000709743  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4409  hypothetical protein  28.28 
 
 		 311 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2216  hypothetical protein  22.11 
 
 		 609 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.747974  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2780  hypothetical protein  27.88 
 
 		 231 aa  43.1  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000279313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4002  hypothetical protein  27 
 
 		 262 aa  42.7  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  0.555235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>