16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2780 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_2780  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  484  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000279313 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2181  hypothetical protein  37.86 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4002  hypothetical protein  40 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  0.555235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4168  hypothetical protein  37.62 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000709743  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2088  hypothetical protein  30.84 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00004808  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1849  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1459 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.873254  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3889  hypothetical protein  28.71 
 
 		 928 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1792  hypothetical protein  28.97 
 
 		 384 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4409  hypothetical protein  35.14 
 
 		 311 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2346  hypothetical protein  25.17 
 
 		 391 aa  49.3  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000237272  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0136  hypothetical protein  25.17 
 
 		 400 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3022  hypothetical protein  31.4 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4248  hypothetical protein  30.08 
 
 		 396 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0344938  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1588  hypothetical protein  27.88 
 
 		 397 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal  0.483169 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2758  hypothetical protein  26.85 
 
 		 459 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932137  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6930  hypothetical protein  29.11 
 
 		 525 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.927705  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>