9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4168 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4168  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000709743  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4002  hypothetical protein  39.18 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  0.555235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2181  hypothetical protein  36.17 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2780  hypothetical protein  37.62 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000279313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4409  hypothetical protein  32.43 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2210  hypothetical protein  33.64 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1588  hypothetical protein  32.67 
 
 		 397 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal  0.483169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1792  hypothetical protein  33.9 
 
 		 384 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2758  hypothetical protein  28.7 
 
 		 459 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932137  normal  0.130604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>