11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2758 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2758  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  945    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932137  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3889  hypothetical protein  44.36 
 
 		 928 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4002  hypothetical protein  32.8 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  0.555235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2181  hypothetical protein  37.97 
 
 		 270 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3865  hypothetical protein  37.14 
 
 		 123 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177283  normal  0.0162983 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4248  hypothetical protein  32.38 
 
 		 396 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0344938  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4352  hypothetical protein  33.04 
 
 		 521 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4409  hypothetical protein  30 
 
 		 311 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2210  hypothetical protein  36.49 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4168  hypothetical protein  28.45 
 
 		 276 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000709743  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2088  hypothetical protein  37.65 
 
 		 380 aa  43.5  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00004808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>