13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2088 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2088  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  789    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00004808  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1792  hypothetical protein  55.15 
 
 		 384 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1588  hypothetical protein  35.56 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal  0.483169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2210  hypothetical protein  35.96 
 
 		 394 aa  229  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4248  hypothetical protein  31.36 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0344938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2055  hypothetical protein  26.58 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2346  hypothetical protein  25.61 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000237272  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0136  hypothetical protein  24.48 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6930  hypothetical protein  24.74 
 
 		 525 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.927705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2780  hypothetical protein  30.84 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000279313 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4352  hypothetical protein  26.89 
 
 		 521 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2181  hypothetical protein  28.93 
 
 		 270 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2758  hypothetical protein  37.65 
 
 		 459 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932137  normal  0.130604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>