12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2346 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0136  hypothetical protein  94.12 
 
 		 400 aa  765    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2346  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  812    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000237272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1792  hypothetical protein  25.14 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1588  hypothetical protein  27.09 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal  0.483169 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4248  hypothetical protein  27.35 
 
 		 396 aa  99.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0344938  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2088  hypothetical protein  25.61 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00004808  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2055  hypothetical protein  24.87 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6930  hypothetical protein  25.32 
 
 		 525 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.927705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2210  hypothetical protein  23.91 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4352  hypothetical protein  23.82 
 
 		 521 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2780  hypothetical protein  25.17 
 
 		 231 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000279313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3022  hypothetical protein  30.21 
 
 		 252 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>