16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4248 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4248  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  815    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0344938  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1588  hypothetical protein  39.43 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal  0.483169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1792  hypothetical protein  30.59 
 
 		 384 aa  176  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2088  hypothetical protein  31.36 
 
 		 380 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00004808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2210  hypothetical protein  28.65 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2055  hypothetical protein  24.87 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2346  hypothetical protein  27.35 
 
 		 391 aa  99.8  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000237272  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0136  hypothetical protein  28.15 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4352  hypothetical protein  24.61 
 
 		 521 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6930  hypothetical protein  30.4 
 
 		 525 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.927705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2758  hypothetical protein  32.38 
 
 		 459 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932137  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4409  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2181  hypothetical protein  24.22 
 
 		 270 aa  47  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4002  hypothetical protein  31 
 
 		 262 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  0.555235 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2780  hypothetical protein  30.08 
 
 		 231 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000279313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3889  hypothetical protein  29.47 
 
 		 928 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>