13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3889 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3889  hypothetical protein  100 
 
 		 928 aa  1874    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3863  hypothetical protein  61.69 
 
 		 243 aa  301  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0634319  normal  0.0303395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3865  hypothetical protein  61.62 
 
 		 123 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177283  normal  0.0162983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2758  hypothetical protein  44.36 
 
 		 459 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932137  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3864  hypothetical protein  60.49 
 
 		 111 aa  104  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611999  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2181  hypothetical protein  40.22 
 
 		 270 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144409  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3862  hypothetical protein  68.29 
 
 		 41 aa  65.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111436  normal  0.0444471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4002  hypothetical protein  32.43 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  0.555235 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2780  hypothetical protein  28.71 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000279313 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6930  hypothetical protein  37.11 
 
 		 525 aa  55.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.927705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4409  hypothetical protein  28.15 
 
 		 311 aa  52  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1792  hypothetical protein  38.64 
 
 		 384 aa  48.5  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2210  hypothetical protein  30.83 
 
 		 394 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>