12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4352 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4352  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1089    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2210  hypothetical protein  24.87 
 
 		 394 aa  96.7  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1588  hypothetical protein  25.19 
 
 		 397 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal  0.483169 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4248  hypothetical protein  24.61 
 
 		 396 aa  87.4  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0344938  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6930  hypothetical protein  24 
 
 		 525 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.927705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1792  hypothetical protein  26.14 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0136  hypothetical protein  23.51 
 
 		 400 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2346  hypothetical protein  23.82 
 
 		 391 aa  54.7  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000237272  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2758  hypothetical protein  33.04 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932137  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2088  hypothetical protein  26.89 
 
 		 380 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00004808  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2055  hypothetical protein  21.99 
 
 		 390 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4002  hypothetical protein  35 
 
 		 262 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  0.555235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>