12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0136 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0136  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  827    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2346  hypothetical protein  94.12 
 
 		 391 aa  765    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000237272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1792  hypothetical protein  24.27 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1588  hypothetical protein  27.53 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal  0.483169 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4248  hypothetical protein  28.15 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0344938  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2088  hypothetical protein  24.48 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00004808  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2055  hypothetical protein  25.53 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6930  hypothetical protein  24.75 
 
 		 525 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.927705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2210  hypothetical protein  24.29 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4352  hypothetical protein  23.51 
 
 		 521 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2780  hypothetical protein  25.17 
 
 		 231 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000279313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3022  hypothetical protein  32.29 
 
 		 252 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>