39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4616 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4616  protein of unknown function DUF1503  100 
 
 		 283 aa  537  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5259  hypothetical protein  34.94 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2998  hypothetical protein  36.94 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6764  protein of unknown function DUF1503  36.99 
 
 		 245 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2951  protein of unknown function DUF1503  37.93 
 
 		 249 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5133  protein of unknown function DUF1503  37.56 
 
 		 257 aa  96.3  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2217  protein of unknown function DUF1503  36.84 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2346  hypothetical protein  42.64 
 
 		 241 aa  87  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  41.04 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5850  hypothetical protein  34.48 
 
 		 249 aa  86.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2255  protein of unknown function DUF1503  34.21 
 
 		 266 aa  85.9  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0650  protein of unknown function DUF1503  37.39 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1875  protein of unknown function DUF1503  34.93 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142051  normal  0.0199341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9205  hypothetical protein  34.36 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0327  hypothetical protein  34.22 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0394  hypothetical protein  33.18 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19770  hypothetical protein  35.53 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5638  hypothetical protein  32.61 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6055  protein of unknown function DUF1503  32.07 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0119  hypothetical protein  41.04 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1989  protein of unknown function DUF1503  34.27 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2915  protein of unknown function DUF1503  34.3 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10337  hypothetical protein  29.38 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6860  protein of unknown function DUF1503  31.34 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5043  hypothetical protein  33.71 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3207  protein of unknown function DUF1503  28.28 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.0564696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0444  hypothetical protein  31.28 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00202884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2467  hypothetical protein  41.61 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0434  hypothetical protein  31.28 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0421  hypothetical protein  31.28 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2202  protein of unknown function DUF1503  32.35 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9026  hypothetical protein  34.91 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2667  protein of unknown function DUF1503  33.04 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1408  protein of unknown function DUF1503  31.25 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0287  hypothetical protein  29.49 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000041503  normal  0.144658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0601  hypothetical protein  31.58 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.492856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4265  hypothetical protein  32.41 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3933  hypothetical protein  36.59 
 
 		 198 aa  42.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0576755  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0474  protein of unknown function DUF1503  34.15 
 
 		 234 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>