38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5043 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5043  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  482  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10337  hypothetical protein  49.8 
 
 		 261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0421  hypothetical protein  52.21 
 
 		 249 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0434  hypothetical protein  52.21 
 
 		 249 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0444  hypothetical protein  52.21 
 
 		 249 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00202884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0287  hypothetical protein  51.21 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000041503  normal  0.144658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0601  hypothetical protein  49 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.492856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  40.41 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9026  hypothetical protein  40.62 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0394  hypothetical protein  38.91 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2951  protein of unknown function DUF1503  37.44 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0327  hypothetical protein  37.09 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6764  protein of unknown function DUF1503  34.38 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5259  hypothetical protein  36.07 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2998  hypothetical protein  32.26 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6055  protein of unknown function DUF1503  33.02 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2346  hypothetical protein  41.25 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0650  protein of unknown function DUF1503  32.21 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2667  protein of unknown function DUF1503  33.75 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4265  hypothetical protein  32.09 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5133  protein of unknown function DUF1503  33.65 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6860  protein of unknown function DUF1503  32.48 
 
 		 247 aa  72  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2217  protein of unknown function DUF1503  29.69 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1875  protein of unknown function DUF1503  30.38 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142051  normal  0.0199341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2467  hypothetical protein  29.41 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5850  hypothetical protein  29.78 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3207  protein of unknown function DUF1503  29.22 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.0564696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5638  hypothetical protein  34.84 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2255  protein of unknown function DUF1503  31.28 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1989  protein of unknown function DUF1503  28.25 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4616  protein of unknown function DUF1503  29.79 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9205  hypothetical protein  33.57 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0119  hypothetical protein  35.51 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2915  protein of unknown function DUF1503  32.08 
 
 		 269 aa  48.9  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19770  hypothetical protein  30.99 
 
 		 292 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1408  protein of unknown function DUF1503  32.57 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0474  protein of unknown function DUF1503  34.6 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2202  protein of unknown function DUF1503  28.07 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>