33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6860 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6860  protein of unknown function DUF1503  100 
 
 		 247 aa  481  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6764  protein of unknown function DUF1503  34.82 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5259  hypothetical protein  31.84 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2998  hypothetical protein  33.98 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725145  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0327  hypothetical protein  30.7 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5043  hypothetical protein  37.35 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2255  protein of unknown function DUF1503  30.8 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5638  hypothetical protein  29.22 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9205  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4616  protein of unknown function DUF1503  31.34 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5133  protein of unknown function DUF1503  29.07 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2951  protein of unknown function DUF1503  29.29 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10337  hypothetical protein  30.77 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2915  protein of unknown function DUF1503  30.27 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0394  hypothetical protein  29.39 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9026  hypothetical protein  32.38 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6055  protein of unknown function DUF1503  31.16 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0601  hypothetical protein  35.06 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.492856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0119  hypothetical protein  30.39 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0287  hypothetical protein  32 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000041503  normal  0.144658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0434  hypothetical protein  27.7 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2467  hypothetical protein  30.12 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0444  hypothetical protein  27.7 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00202884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0421  hypothetical protein  27.7 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1408  protein of unknown function DUF1503  27 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1875  protein of unknown function DUF1503  28.57 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142051  normal  0.0199341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0650  protein of unknown function DUF1503  29.83 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5850  hypothetical protein  29.6 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  26.36 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2346  hypothetical protein  29.2 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837592  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19770  hypothetical protein  29.41 
 
 		 292 aa  45.4  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128439  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2217  protein of unknown function DUF1503  28.45 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2667  protein of unknown function DUF1503  31.45 
 
 		 238 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>