24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1408 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1408  protein of unknown function DUF1503  100 
 
 		 278 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9205  hypothetical protein  25.39 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5850  hypothetical protein  24.91 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6764  protein of unknown function DUF1503  31.92 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5259  hypothetical protein  28.36 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2346  hypothetical protein  29.56 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2998  hypothetical protein  27.71 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0650  protein of unknown function DUF1503  25.64 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2467  hypothetical protein  35.42 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5133  protein of unknown function DUF1503  27.57 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0327  hypothetical protein  27.82 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0394  hypothetical protein  28.97 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2255  protein of unknown function DUF1503  26.88 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6860  protein of unknown function DUF1503  27 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4616  protein of unknown function DUF1503  31.4 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2667  protein of unknown function DUF1503  29.73 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  29.33 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0119  hypothetical protein  36.67 
 
 		 246 aa  48.9  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2915  protein of unknown function DUF1503  28.33 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5043  hypothetical protein  32.57 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1875  protein of unknown function DUF1503  28.79 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142051  normal  0.0199341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2951  protein of unknown function DUF1503  26.59 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9026  hypothetical protein  32.62 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6055  protein of unknown function DUF1503  25.62 
 
 		 241 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>