35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2667 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2667  protein of unknown function DUF1503  100 
 
 		 238 aa  461  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2467  hypothetical protein  45.24 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3207  protein of unknown function DUF1503  36.02 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.0564696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2915  protein of unknown function DUF1503  43.21 
 
 		 269 aa  92.8  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0650  protein of unknown function DUF1503  33.33 
 
 		 249 aa  88.6  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0394  hypothetical protein  34.43 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0327  hypothetical protein  34.11 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6764  protein of unknown function DUF1503  35.05 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4265  hypothetical protein  32.08 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2998  hypothetical protein  33.98 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5259  hypothetical protein  33.74 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5850  hypothetical protein  31.08 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9205  hypothetical protein  38.06 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2346  hypothetical protein  32.84 
 
 		 241 aa  72  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5043  hypothetical protein  34.76 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19770  hypothetical protein  38.64 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1989  protein of unknown function DUF1503  29.78 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0474  protein of unknown function DUF1503  36.8 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5638  hypothetical protein  29.65 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6055  protein of unknown function DUF1503  29.36 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  32.32 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2951  protein of unknown function DUF1503  28.77 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2217  protein of unknown function DUF1503  33.5 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5133  protein of unknown function DUF1503  31.5 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0444  hypothetical protein  28.14 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00202884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0434  hypothetical protein  28.14 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0421  hypothetical protein  27.39 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1875  protein of unknown function DUF1503  31.75 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142051  normal  0.0199341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0287  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000041503  normal  0.144658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1408  protein of unknown function DUF1503  29.73 
 
 		 278 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10337  hypothetical protein  28.29 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0601  hypothetical protein  29.11 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.492856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4616  protein of unknown function DUF1503  30.94 
 
 		 283 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9026  hypothetical protein  29.87 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6860  protein of unknown function DUF1503  31.45 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>