38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5133 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5133  protein of unknown function DUF1503  100 
 
 
257 aa  507  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1875  protein of unknown function DUF1503  44.49 
 
 
260 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142051  normal  0.0199341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0119  hypothetical protein  42.8 
 
 
246 aa  165  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5259  hypothetical protein  39.3 
 
 
255 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2255  protein of unknown function DUF1503  40.46 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2998  hypothetical protein  39.3 
 
 
255 aa  136  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725145  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2346  hypothetical protein  33.73 
 
 
241 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6764  protein of unknown function DUF1503  32.4 
 
 
245 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0650  protein of unknown function DUF1503  31.9 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4616  protein of unknown function DUF1503  37.09 
 
 
283 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2951  protein of unknown function DUF1503  35.24 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2202  protein of unknown function DUF1503  32.64 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6055  protein of unknown function DUF1503  33.5 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0394  hypothetical protein  31.53 
 
 
253 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9205  hypothetical protein  34.25 
 
 
254 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10337  hypothetical protein  31.1 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  32.05 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0601  hypothetical protein  35.25 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.492856  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0327  hypothetical protein  30.29 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5043  hypothetical protein  37.5 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5850  hypothetical protein  29.86 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2217  protein of unknown function DUF1503  29.69 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19770  hypothetical protein  32.56 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128439  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0421  hypothetical protein  31.88 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0287  hypothetical protein  30.16 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000041503  normal  0.144658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6860  protein of unknown function DUF1503  29.07 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0444  hypothetical protein  31.88 
 
 
249 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00202884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0434  hypothetical protein  31.88 
 
 
249 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2915  protein of unknown function DUF1503  28.46 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5638  hypothetical protein  30.33 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2667  protein of unknown function DUF1503  31.5 
 
 
238 aa  58.9  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1408  protein of unknown function DUF1503  27.57 
 
 
278 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3207  protein of unknown function DUF1503  28.51 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.0564696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4265  hypothetical protein  27.88 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2467  hypothetical protein  26.52 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9026  hypothetical protein  30.48 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1989  protein of unknown function DUF1503  28.67 
 
 
261 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0474  protein of unknown function DUF1503  31.02 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>