32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0119 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0119  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  478  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2255  protein of unknown function DUF1503  47.84 
 
 
266 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5133  protein of unknown function DUF1503  42.8 
 
 
257 aa  164  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1875  protein of unknown function DUF1503  45.89 
 
 
260 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142051  normal  0.0199341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5259  hypothetical protein  40 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2998  hypothetical protein  38.79 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  37.86 
 
 
272 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6764  protein of unknown function DUF1503  32.46 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10337  hypothetical protein  33.78 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2951  protein of unknown function DUF1503  34.86 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2202  protein of unknown function DUF1503  39.22 
 
 
250 aa  68.6  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4616  protein of unknown function DUF1503  40.74 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0287  hypothetical protein  37.01 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000041503  normal  0.144658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0421  hypothetical protein  38.52 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5850  hypothetical protein  36.96 
 
 
249 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2346  hypothetical protein  29.95 
 
 
241 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0434  hypothetical protein  38.52 
 
 
249 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0444  hypothetical protein  38.52 
 
 
249 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00202884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6860  protein of unknown function DUF1503  30.88 
 
 
247 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5043  hypothetical protein  37.14 
 
 
246 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0601  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.492856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9205  hypothetical protein  30.62 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0394  hypothetical protein  31.47 
 
 
253 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0650  protein of unknown function DUF1503  33.33 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9026  hypothetical protein  32.5 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0327  hypothetical protein  30.09 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6055  protein of unknown function DUF1503  29.07 
 
 
241 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1408  protein of unknown function DUF1503  29.69 
 
 
278 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5638  hypothetical protein  28.76 
 
 
249 aa  48.5  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2217  protein of unknown function DUF1503  36 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2915  protein of unknown function DUF1503  32.52 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19770  hypothetical protein  31.9 
 
 
292 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>