32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2255 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2255  protein of unknown function DUF1503  100 
 
 
266 aa  521  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0119  hypothetical protein  48.71 
 
 
246 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5133  protein of unknown function DUF1503  41.98 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5259  hypothetical protein  40.5 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1875  protein of unknown function DUF1503  39.17 
 
 
260 aa  125  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142051  normal  0.0199341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2998  hypothetical protein  38.4 
 
 
255 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725145  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2346  hypothetical protein  36.36 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837592  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2202  protein of unknown function DUF1503  35.29 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4616  protein of unknown function DUF1503  32.3 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  32.88 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6764  protein of unknown function DUF1503  30.9 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6055  protein of unknown function DUF1503  29.68 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0394  hypothetical protein  30.84 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0327  hypothetical protein  30.05 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6860  protein of unknown function DUF1503  30.8 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2951  protein of unknown function DUF1503  30.28 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5850  hypothetical protein  33.49 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1408  protein of unknown function DUF1503  26.88 
 
 
278 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10337  hypothetical protein  27.33 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5043  hypothetical protein  32.37 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2217  protein of unknown function DUF1503  28.69 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2467  hypothetical protein  34.68 
 
 
266 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0601  hypothetical protein  29.01 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.492856  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0287  hypothetical protein  27.65 
 
 
248 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000041503  normal  0.144658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0421  hypothetical protein  31.3 
 
 
249 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2915  protein of unknown function DUF1503  30.15 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9205  hypothetical protein  28.84 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0650  protein of unknown function DUF1503  26.89 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0444  hypothetical protein  30.53 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00202884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0434  hypothetical protein  30.53 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5638  hypothetical protein  27.48 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19770  hypothetical protein  36.11 
 
 
292 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>