36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10337 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10337  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  519  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0421  hypothetical protein  56.57 
 
 
249 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0434  hypothetical protein  56.57 
 
 
249 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0444  hypothetical protein  56.57 
 
 
249 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00202884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0287  hypothetical protein  58.57 
 
 
248 aa  276  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000041503  normal  0.144658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0601  hypothetical protein  54.58 
 
 
248 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.492856  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5043  hypothetical protein  49.8 
 
 
246 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  37.01 
 
 
272 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9026  hypothetical protein  38.91 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5259  hypothetical protein  31.03 
 
 
255 aa  92  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6764  protein of unknown function DUF1503  35.85 
 
 
245 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2951  protein of unknown function DUF1503  32.03 
 
 
249 aa  86.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0650  protein of unknown function DUF1503  28.02 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2998  hypothetical protein  28.12 
 
 
255 aa  77  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725145  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5133  protein of unknown function DUF1503  31.1 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0394  hypothetical protein  32.54 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0327  hypothetical protein  32.72 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4265  hypothetical protein  29.39 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2346  hypothetical protein  29.11 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6055  protein of unknown function DUF1503  26 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0119  hypothetical protein  32.65 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3207  protein of unknown function DUF1503  27.5 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.0564696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6860  protein of unknown function DUF1503  30.77 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2255  protein of unknown function DUF1503  27.33 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4616  protein of unknown function DUF1503  28.04 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1989  protein of unknown function DUF1503  25.64 
 
 
261 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1875  protein of unknown function DUF1503  30.66 
 
 
260 aa  55.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142051  normal  0.0199341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9205  hypothetical protein  28.17 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2217  protein of unknown function DUF1503  28.05 
 
 
252 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2467  hypothetical protein  25.86 
 
 
266 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2667  protein of unknown function DUF1503  28.29 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19770  hypothetical protein  27.22 
 
 
292 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0474  protein of unknown function DUF1503  32.37 
 
 
234 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5638  hypothetical protein  28.99 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2202  protein of unknown function DUF1503  28.24 
 
 
250 aa  48.9  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5850  hypothetical protein  27.06 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>