31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5638 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5638  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  497  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0394  hypothetical protein  38.62 
 
 
253 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0327  hypothetical protein  37.8 
 
 
253 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2951  protein of unknown function DUF1503  33.62 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6764  protein of unknown function DUF1503  32.27 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5850  hypothetical protein  27.47 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2998  hypothetical protein  28.89 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0650  protein of unknown function DUF1503  32.29 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6055  protein of unknown function DUF1503  33.33 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4616  protein of unknown function DUF1503  31.11 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6860  protein of unknown function DUF1503  29.22 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2667  protein of unknown function DUF1503  29.65 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3207  protein of unknown function DUF1503  29.24 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.0564696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9205  hypothetical protein  31.41 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2915  protein of unknown function DUF1503  30.08 
 
 
269 aa  62.4  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1875  protein of unknown function DUF1503  31.25 
 
 
260 aa  62  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142051  normal  0.0199341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5259  hypothetical protein  28.51 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  28.26 
 
 
272 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5133  protein of unknown function DUF1503  30.33 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2346  hypothetical protein  27.83 
 
 
241 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5043  hypothetical protein  34.87 
 
 
246 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2467  hypothetical protein  26.42 
 
 
266 aa  58.9  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1989  protein of unknown function DUF1503  26.25 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4265  hypothetical protein  23.98 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2217  protein of unknown function DUF1503  29.28 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10337  hypothetical protein  28.99 
 
 
261 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0119  hypothetical protein  28.76 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0474  protein of unknown function DUF1503  30.21 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0601  hypothetical protein  31.37 
 
 
248 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.492856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9026  hypothetical protein  26.67 
 
 
262 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2255  protein of unknown function DUF1503  27.48 
 
 
266 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>