48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2632 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2632    100 
 
 		 1449 bp  2872    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  85.14 
 
 		 1389 bp  281  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  85.14 
 
 		 1389 bp  281  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  85.14 
 
 		 1389 bp  281  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  85.14 
 
 		 1389 bp  281  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  83.49 
 
 		 1389 bp  216  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0739  hypothetical protein  86.4 
 
 		 570 bp  200  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0761    92.5 
 
 		 510 bp  167  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000464715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5786    81.62 
 
 		 1385 bp  143  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  88.79 
 
 		 1395 bp  117  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  85.59 
 
 		 1398 bp  99.6  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  85.59 
 
 		 1398 bp  99.6  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  83.21 
 
 		 1395 bp  89.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4784    83.21 
 
 		 1395 bp  89.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.478308  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  83.21 
 
 		 1395 bp  89.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  83.21 
 
 		 1395 bp  89.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4703    83.21 
 
 		 1395 bp  89.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3087  hypothetical protein  91.04 
 
 		 384 bp  85.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0760419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  83.9 
 
 		 1398 bp  83.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  83.9 
 
 		 1398 bp  83.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  83.9 
 
 		 1398 bp  83.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  83.9 
 
 		 1398 bp  83.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  83.9 
 
 		 1398 bp  83.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  83.9 
 
 		 1398 bp  83.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1180  hypothetical protein  83.96 
 
 		 240 bp  75.8  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3052  hypothetical protein  83.33 
 
 		 345 bp  67.9  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  82.24 
 
 		 1302 bp  61.9  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  82.24 
 
 		 1302 bp  61.9  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  82.24 
 
 		 1302 bp  61.9  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  83.95 
 
 		 1407 bp  58  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  83.95 
 
 		 1407 bp  58  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  83.95 
 
 		 1407 bp  58  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  83.95 
 
 		 1407 bp  58  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  83.95 
 
 		 1407 bp  58  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  83.95 
 
 		 1407 bp  58  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  83.95 
 
 		 1407 bp  58  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  83.95 
 
 		 1407 bp  58  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  83.95 
 
 		 1407 bp  58  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4246  AMP nucleosidase  100 
 
 		 1482 bp  50.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.565959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4957  AMP nucleosidase  100 
 
 		 1518 bp  50.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0485  AMP nucleosidase  100 
 
 		 1482 bp  50.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486442  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3701  AMP nucleosidase  100 
 
 		 1488 bp  50.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.507304 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3569  AMP nucleosidase  100 
 
 		 1539 bp  50.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0254113  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3709  AMP nucleosidase  100 
 
 		 1482 bp  50.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.456072  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3012  hypothetical protein  91.89 
 
 		 732 bp  50.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3401  AMP nucleosidase  100 
 
 		 1554 bp  50.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0546432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  85.71 
 
 		 1422 bp  48.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2704  AMP nucleosidase  96.43 
 
 		 1485 bp  48.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>