38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5786 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5786    100 
 
 		 1385 bp  2746    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  80.35 
 
 		 1389 bp  561  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  80.35 
 
 		 1389 bp  561  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  80.35 
 
 		 1389 bp  561  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  80.35 
 
 		 1389 bp  561  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  80.07 
 
 		 1389 bp  515  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3052  hypothetical protein  87.82 
 
 		 345 bp  226  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2632    81.62 
 
 		 1449 bp  143  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3087  hypothetical protein  82.63 
 
 		 384 bp  115  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0760419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0761    83.89 
 
 		 510 bp  105  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000464715  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  83.11 
 
 		 1395 bp  95.6  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  88.89 
 
 		 1398 bp  89.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  88.89 
 
 		 1398 bp  89.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  86.42 
 
 		 1398 bp  73.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  86.42 
 
 		 1398 bp  73.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  86.42 
 
 		 1398 bp  73.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  86.42 
 
 		 1398 bp  73.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  86.42 
 
 		 1398 bp  73.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  86.42 
 
 		 1398 bp  73.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3012  hypothetical protein  88.71 
 
 		 732 bp  67.9  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  80.86 
 
 		 1395 bp  60  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  80.86 
 
 		 1395 bp  60  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  80.86 
 
 		 1395 bp  60  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4703    80.86 
 
 		 1395 bp  60  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4784    80.86 
 
 		 1395 bp  60  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.478308  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2159  hypothetical protein  90 
 
 		 627 bp  60  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.442005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3439  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 		 2838 bp  54  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571319  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  82.93 
 
 		 1407 bp  52  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  82.93 
 
 		 1407 bp  52  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  82.93 
 
 		 1407 bp  52  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  82.93 
 
 		 1407 bp  52  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  82.93 
 
 		 1407 bp  52  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  82.93 
 
 		 1407 bp  52  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  82.93 
 
 		 1407 bp  52  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  82.93 
 
 		 1407 bp  52  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  82.93 
 
 		 1407 bp  52  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6873  hypothetical protein  100 
 
 		 1206 bp  48.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.358007  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2668    96.43 
 
 		 107 bp  48.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0502051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>