21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1697 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1697  hypothetical protein  100 
 
 		 586 aa  1102    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.181141  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4489  hypothetical protein  29.76 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0709  hypothetical protein  36.59 
 
 		 382 aa  90.9  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  decreased coverage  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4492  hypothetical protein  34.04 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0292561  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0767  hypothetical protein  36.11 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3683  hypothetical protein  39.33 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593683  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  38.58 
 
 		 671 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  34.64 
 
 		 652 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  34.64 
 
 		 652 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  60.66 
 
 		 669 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  57.38 
 
 		 619 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  35.43 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  34.42 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  53.23 
 
 		 605 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  27.64 
 
 		 495 aa  57  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  57.63 
 
 		 626 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  51.79 
 
 		 604 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0721  hypothetical protein  34.34 
 
 		 420 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.353203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3232  copper resistance protein B  34.71 
 
 		 397 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197761  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2835  NADH dehydrogenase subunit B  35.19 
 
 		 196 aa  44.3  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0973077  normal  0.124662 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  37.04 
 
 		 175 aa  43.5  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>