More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1603 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1603  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
417 aa  808    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.048422  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.36 
 
 
418 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.21 
 
 
418 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0385  gamma-glutamyl phosphate reductase  69.15 
 
 
413 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.427307  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0456  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.69 
 
 
413 aa  487  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7264  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.63 
 
 
419 aa  485  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  64.72 
 
 
429 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1194  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.75 
 
 
420 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.21 
 
 
418 aa  478  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1227  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.22 
 
 
419 aa  476  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.683793  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.01 
 
 
424 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.48 
 
 
445 aa  473  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1818  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.3 
 
 
429 aa  474  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.46 
 
 
430 aa  463  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5256  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.57 
 
 
418 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1507  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.54 
 
 
448 aa  449  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0477436  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11440  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  62.2 
 
 
446 aa  448  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.77 
 
 
418 aa  445  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3197  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.41 
 
 
434 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12455  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.71 
 
 
415 aa  444  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.440889 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2279  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.36 
 
 
434 aa  437  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0615198  hitchhiker  0.00168342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2813  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.5 
 
 
424 aa  433  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0167812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.32 
 
 
418 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1645  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.59 
 
 
431 aa  433  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  hitchhiker  0.00108459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2644  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.22 
 
 
415 aa  433  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.842217  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3538  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.71 
 
 
415 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3543  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.71 
 
 
415 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3611  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.71 
 
 
415 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0809422  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.13 
 
 
414 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3934  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.27 
 
 
415 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.18 
 
 
419 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3452  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.77 
 
 
432 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0199566  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2387  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.31 
 
 
450 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0346385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 
415 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.51 
 
 
419 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10150  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  58.65 
 
 
449 aa  415  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0955423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 
415 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 
415 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
415 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3028  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 
415 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00693675  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2141  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.83 
 
 
459 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000141215 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 
415 aa  415  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.9 
 
 
415 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2672  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.8 
 
 
424 aa  408  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322038  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 
419 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0784  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.93 
 
 
423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.38 
 
 
415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.89 
 
 
415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.86 
 
 
414 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2781  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
414 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2992  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
414 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.440021  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1018  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.12 
 
 
425 aa  404  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18230  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  56.14 
 
 
426 aa  403  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374677  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2993  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
415 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471186  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2884  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.37 
 
 
428 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.88 
 
 
419 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2252  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
415 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.628785  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.56 
 
 
413 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.89 
 
 
415 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1268  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  54.29 
 
 
409 aa  395  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 
418 aa  393  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.49 
 
 
418 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 
418 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.98 
 
 
418 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.52 
 
 
418 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.52 
 
 
419 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.99 
 
 
420 aa  382  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2009  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.99 
 
 
425 aa  382  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00109825  hitchhiker  0.000000000000564296 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.67 
 
 
415 aa  382  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2873  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.64 
 
 
413 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.51 
 
 
421 aa  381  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.19 
 
 
415 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.28 
 
 
427 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.42 
 
 
415 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.38 
 
 
418 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.99 
 
 
418 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 
434 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.63 
 
 
429 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.86 
 
 
418 aa  377  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.84 
 
 
424 aa  378  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1716  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.46 
 
 
413 aa  376  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.23 
 
 
418 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.52 
 
 
418 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.93 
 
 
418 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
420 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3011  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
427 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61903  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 
421 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.68 
 
 
424 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 
421 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.06 
 
 
446 aa  371  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.78 
 
 
415 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1084  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.77 
 
 
426 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.99 
 
 
423 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.16 
 
 
416 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.16 
 
 
416 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.91 
 
 
411 aa  366  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.62 
 
 
417 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.6 
 
 
428 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.91 
 
 
416 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.78 
 
 
416 aa  366  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>