24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0786 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0786  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 699 aa  1362    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2865  Fibronectin type III domain protein  29.3 
 
 		 759 aa  96.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  30.94 
 
 		 1221 aa  67.4  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  28.2 
 
 		 9585 aa  62  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  32.57 
 
 		 2011 aa  58.9  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  33.56 
 
 		 1063 aa  53.9  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  34.6 
 
 		 3911 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  31.4 
 
 		 2040 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  27.91 
 
 		 1887 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  31 
 
 		 744 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  27.24 
 
 		 771 aa  48.9  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  33.78 
 
 		 2084 aa  48.5  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  30.49 
 
 		 2052 aa  48.9  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  33.54 
 
 		 428 aa  48.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  35.65 
 
 		 514 aa  47.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  39.13 
 
 		 614 aa  47.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  41.12 
 
 		 655 aa  47.8  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  27.45 
 
 		 768 aa  47.4  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  30.45 
 
 		 2170 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  30.2 
 
 		 409 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  33.11 
 
 		 1735 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  30.19 
 
 		 2047 aa  46.6  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  32.04 
 
 		 1004 aa  44.3  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  28.7 
 
 		 762 aa  43.9  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>