149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0182 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0182  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 		 341 aa  665    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1878  carbamate kinase  62.7 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1504  carbamate kinase  64.08 
 
 		 323 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6542  Carbamate kinase  63.99 
 
 		 314 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567735 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2214  aspartate/glutamate/uridylate kinase  63.01 
 
 		 300 aa  323  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.350348  normal  0.825943 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1948  carbamate kinase  47.56 
 
 		 314 aa  262  4.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.572312  hitchhiker  0.000272947 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0247  carbamate kinase  47.13 
 
 		 314 aa  252  7e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2117  carbamate kinase  42.72 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.43365  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2167  carbamate kinase  40.65 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0485  carbamate kinase  39.74 
 
 		 313 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000618454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0475  carbamate kinase  39.2 
 
 		 320 aa  238  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4895  carbamate kinase  39.2 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.428226  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0344  carbamate kinase  38.89 
 
 		 320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0423  carbamate kinase  39.62 
 
 		 320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0410  carbamate kinase  38.89 
 
 		 320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00340879 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0069  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  38.05 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1788  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  39.8 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2848  carbamate kinase  46.75 
 
 		 313 aa  232  7.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.431073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0351  carbamate kinase  37.62 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06560  carbamate kinase  41.56 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.298804 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1927  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  37.62 
 
 		 312 aa  226  4e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0219816  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2487  carbamate kinase  46.1 
 
 		 314 aa  222  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2177  carbamate kinase  45.69 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0172  carbamate kinase  43.13 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0183  carbamate kinase  38.29 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00850  carbamate kinase  43.81 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0269  carbamate kinase  40.88 
 
 		 318 aa  218  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000010285  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2650  carbamate kinase  37.86 
 
 		 313 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2786  carbamate kinase  44.81 
 
 		 314 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0673  carbamate kinase  40.44 
 
 		 317 aa  215  7e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000329636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1820  carbamate kinase  40.86 
 
 		 330 aa  215  8e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2426  carbamate kinase  46.53 
 
 		 318 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2656  carbamate kinase  36.48 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.168651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2712  carbamate kinase  36.48 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1389  carbamate kinase  45.05 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373109  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2318  carbamate kinase  39.75 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1106  carbamate kinase  41.74 
 
 		 308 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0757388  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05980  carbamate kinase  41.67 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2359  carbamate kinase  42.63 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0160  carbamate kinase  36.71 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2409  carbamate kinase  42.63 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12560  carbamate kinase  40.84 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4199  carbamate kinase  41.12 
 
 		 318 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169191 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0164  carbamate kinase  36.39 
 
 		 314 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03712  Carbamate kinase-like protein yahI  40.79 
 
 		 346 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03661  hypothetical protein  40.79 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0242  carbamate kinase  38.49 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000109106  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0039  carbamate kinase  39.67 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6441  carbamate kinase  44.3 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841619  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02380  carbamate kinase  40.63 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.720538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1838  carbamate kinase  40.19 
 
 		 301 aa  207  3e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.955077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68350  carbamate kinase  42.09 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.221419 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1228  carbamate kinase  34.6 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1253  carbamate kinase  34.6 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.661641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1947  carbamate kinase  40.95 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal  0.423275 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2476  carbamate kinase  39.5 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2319  carbamate kinase  40.72 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5913  carbamate kinase  41.46 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1665  carbamate kinase  37.13 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0998  carbamate kinase  41.01 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4225  carbamate kinase  41.32 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.375863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0529  carbamate kinase  43.89 
 
 		 298 aa  203  4e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1036  carbamate kinase  40.69 
 
 		 309 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873124  normal  0.536796 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3444  carbamate kinase  37.54 
 
 		 312 aa  202  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02546  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1620  carbamate kinase  40.59 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0999  carbamate kinase  40.69 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.782851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0679  carbamate kinase  40 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.378738 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0426  carbamate kinase  38.61 
 
 		 310 aa  199  6e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2798  Carbamate kinase  40.76 
 
 		 311 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1429  carbamate kinase  37.79 
 
 		 310 aa  198  9e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0451  carbamate kinase  42.26 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0361431 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00471  predicted carbamate kinase  44.19 
 
 		 297 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0787  carbamate kinase  36.31 
 
 		 312 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0595  carbamate kinase  44.19 
 
 		 297 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00468071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0622  carbamate kinase  43.59 
 
 		 297 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3101  carbamate kinase  44.19 
 
 		 297 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00476  hypothetical protein  44.19 
 
 		 297 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3092  carbamate kinase  44.19 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0312776  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3199  carbamate kinase  37.9 
 
 		 310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4388  carbamate kinase  40.31 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692138  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0047  carbamate kinase  39.8 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0559  carbamate kinase  44.19 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0136389  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2125  carbamate kinase  34.31 
 
 		 308 aa  195  7e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0818  carbamate kinase  37.9 
 
 		 310 aa  195  9e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3034  carbamate kinase  37.9 
 
 		 310 aa  195  9e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0834  carbamate kinase  37.9 
 
 		 310 aa  195  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3007  carbamate kinase  37.9 
 
 		 310 aa  195  9e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0566  carbamate kinase  44.19 
 
 		 297 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.16633  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02707  predicted amino acid kinase  38.34 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2352  carbamate kinase  34.18 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2686  carbamate kinase  41.19 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0029  carbamate kinase  34.97 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4164  carbamate kinase  37.58 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02669  hypothetical protein  38.34 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2126  carbamate kinase  43.37 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.118318  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1984  carbamate kinase  43.37 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06680  carbamate kinase  37.01 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1966  carbamate kinase  43.37 
 
 		 313 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0913  carbamate kinase  43.18 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3141  putative carbamate kinase  42.21 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463314  normal  0.769623 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>