156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2214 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2214  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 
300 aa  587  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.350348  normal  0.825943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6542  Carbamate kinase  70.95 
 
 
314 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1878  carbamate kinase  62.58 
 
 
316 aa  338  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1504  carbamate kinase  61.62 
 
 
323 aa  317  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0182  aspartate/glutamate/uridylate kinase  63.01 
 
 
341 aa  310  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1948  carbamate kinase  48.18 
 
 
314 aa  268  7e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.572312  hitchhiker  0.000272947 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0247  carbamate kinase  47.4 
 
 
314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1927  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  41.79 
 
 
312 aa  236  3e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0219816  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0069  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  40.4 
 
 
313 aa  236  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2167  carbamate kinase  43.6 
 
 
318 aa  228  9e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0351  carbamate kinase  41.98 
 
 
321 aa  227  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0344  carbamate kinase  42.09 
 
 
320 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0410  carbamate kinase  42.09 
 
 
320 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00340879 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0039  carbamate kinase  46.3 
 
 
309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0475  carbamate kinase  41.75 
 
 
320 aa  225  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2117  carbamate kinase  42.71 
 
 
312 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.43365  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4895  carbamate kinase  41.75 
 
 
320 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.428226  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2848  carbamate kinase  46.44 
 
 
313 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.431073  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1788  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  43.07 
 
 
311 aa  223  3e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0485  carbamate kinase  43.64 
 
 
313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000618454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2487  carbamate kinase  47.26 
 
 
314 aa  222  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0423  carbamate kinase  41.41 
 
 
320 aa  222  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1820  carbamate kinase  44.14 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1429  carbamate kinase  43.3 
 
 
310 aa  219  6e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2786  carbamate kinase  45.55 
 
 
314 aa  218  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4199  carbamate kinase  44.56 
 
 
318 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03661  hypothetical protein  44.22 
 
 
366 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03712  Carbamate kinase-like protein yahI  44.22 
 
 
346 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2656  carbamate kinase  41.52 
 
 
322 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.168651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2712  carbamate kinase  41.52 
 
 
322 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0172  carbamate kinase  46.15 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2319  carbamate kinase  43.69 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0529  carbamate kinase  48.91 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2318  carbamate kinase  43.84 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0047  carbamate kinase  43.01 
 
 
311 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3444  carbamate kinase  40.48 
 
 
312 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02546  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0269  carbamate kinase  42.76 
 
 
318 aa  206  3e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000010285  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2409  carbamate kinase  46.13 
 
 
301 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2359  carbamate kinase  46.13 
 
 
301 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2798  Carbamate kinase  45.07 
 
 
311 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1838  carbamate kinase  40.75 
 
 
301 aa  202  6e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.955077  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06680  carbamate kinase  40.48 
 
 
310 aa  201  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0183  carbamate kinase  40.48 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2476  carbamate kinase  41.32 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2650  carbamate kinase  38.18 
 
 
313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0673  carbamate kinase  41.69 
 
 
317 aa  199  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000329636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2426  carbamate kinase  44.72 
 
 
318 aa  198  9e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1620  carbamate kinase  42.91 
 
 
298 aa  198  9e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0164  carbamate kinase  39.22 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0160  carbamate kinase  39.22 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3141  putative carbamate kinase  41.22 
 
 
316 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463314  normal  0.769623 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0029  carbamate kinase  39.19 
 
 
310 aa  196  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1228  carbamate kinase  36.95 
 
 
311 aa  196  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1253  carbamate kinase  36.95 
 
 
311 aa  196  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.661641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0388  putative carbamate kinase  42.28 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.662634 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0818  carbamate kinase  40.96 
 
 
310 aa  196  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0426  carbamate kinase  41.98 
 
 
310 aa  196  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3034  carbamate kinase  40.96 
 
 
310 aa  196  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0834  carbamate kinase  40.96 
 
 
310 aa  196  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3007  carbamate kinase  40.96 
 
 
310 aa  196  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4164  carbamate kinase  40.96 
 
 
310 aa  195  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0353  putative carbamate kinase  42.28 
 
 
316 aa  195  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2177  carbamate kinase  44.86 
 
 
304 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02707  predicted amino acid kinase  40.61 
 
 
310 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0242  carbamate kinase  41.58 
 
 
313 aa  195  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000109106  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02669  hypothetical protein  40.61 
 
 
310 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3199  carbamate kinase  40.61 
 
 
310 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1665  carbamate kinase  39.58 
 
 
313 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0383  putative carbamate kinase  41.61 
 
 
316 aa  193  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0341  putative carbamate kinase  41.95 
 
 
316 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1389  carbamate kinase  42.91 
 
 
314 aa  192  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373109  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06560  carbamate kinase  38.85 
 
 
319 aa  190  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.298804 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3283  Carbamate kinase  41.61 
 
 
316 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4868  carbamate kinase  43.66 
 
 
310 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4720  carbamate kinase  43.66 
 
 
310 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3300  putative carbamate kinase  41.61 
 
 
316 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.777293  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4813  carbamate kinase  43.66 
 
 
310 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.42996  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2686  carbamate kinase  44.79 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4750  carbamate kinase  43.31 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2126  carbamate kinase  45.26 
 
 
312 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.118318  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4388  carbamate kinase  44.56 
 
 
309 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692138  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1984  carbamate kinase  45.26 
 
 
313 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193138  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4849  carbamate kinase  43.66 
 
 
310 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4225  carbamate kinase  42.96 
 
 
309 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.375863  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0999  carbamate kinase  42.61 
 
 
309 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.782851  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1875  carbamate kinase  46.67 
 
 
303 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1966  carbamate kinase  44.91 
 
 
313 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0998  carbamate kinase  42.61 
 
 
309 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00278  predicted carbamate kinase-like protein  41.28 
 
 
316 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2352  carbamate kinase  35.69 
 
 
310 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00282  hypothetical protein  41.28 
 
 
316 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1147  carbamate kinase  44.91 
 
 
312 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.506597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1587  carbamate kinase  44.91 
 
 
313 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0246  carbamate kinase  44.91 
 
 
313 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264579  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0913  carbamate kinase  44.91 
 
 
313 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1036  carbamate kinase  42.27 
 
 
309 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873124  normal  0.536796 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05980  carbamate kinase  38.05 
 
 
320 aa  187  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2386  carbamate kinase  44.52 
 
 
312 aa  186  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0668132  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6441  carbamate kinase  42.81 
 
 
312 aa  185  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841619  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0659  carbamate kinase  44.41 
 
 
298 aa  185  8e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>