147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0047 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0047  carbamate kinase  100 
 
 
311 aa  627  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2786  carbamate kinase  63.52 
 
 
314 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2487  carbamate kinase  63.93 
 
 
314 aa  388  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1948  carbamate kinase  46.6 
 
 
314 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.572312  hitchhiker  0.000272947 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1927  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  44.01 
 
 
312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0219816  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0172  carbamate kinase  47.27 
 
 
307 aa  258  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1788  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  42.81 
 
 
311 aa  252  6e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1820  carbamate kinase  45.1 
 
 
330 aa  249  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0247  carbamate kinase  43.18 
 
 
314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2177  carbamate kinase  44.98 
 
 
304 aa  243  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6441  carbamate kinase  46.23 
 
 
312 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841619  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0164  carbamate kinase  41.53 
 
 
314 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0039  carbamate kinase  45.48 
 
 
309 aa  236  3e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2117  carbamate kinase  41.94 
 
 
312 aa  236  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.43365  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1875  carbamate kinase  44.05 
 
 
303 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0485  carbamate kinase  43.83 
 
 
313 aa  236  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000618454  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2167  carbamate kinase  42.27 
 
 
318 aa  234  9e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02707  predicted amino acid kinase  43.87 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0818  carbamate kinase  43.87 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02669  hypothetical protein  43.87 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0160  carbamate kinase  41.21 
 
 
314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1429  carbamate kinase  46.15 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3034  carbamate kinase  43.87 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0834  carbamate kinase  43.87 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3007  carbamate kinase  43.87 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4164  carbamate kinase  43.87 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1106  carbamate kinase  43.32 
 
 
308 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0757388  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3199  carbamate kinase  43.55 
 
 
310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0069  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  41.83 
 
 
313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2686  carbamate kinase  45.63 
 
 
309 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4388  carbamate kinase  43.93 
 
 
309 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692138  normal  0.186068 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03712  Carbamate kinase-like protein yahI  42.54 
 
 
346 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03661  hypothetical protein  42.54 
 
 
366 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4199  carbamate kinase  42.22 
 
 
318 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169191 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0529  carbamate kinase  45.13 
 
 
298 aa  225  6e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06680  carbamate kinase  42.63 
 
 
310 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5913  carbamate kinase  43.14 
 
 
310 aa  222  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68350  carbamate kinase  43.14 
 
 
310 aa  221  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.221419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0999  carbamate kinase  44.59 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.782851  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2476  carbamate kinase  42.26 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0351  carbamate kinase  41.23 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1036  carbamate kinase  44.26 
 
 
309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873124  normal  0.536796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4225  carbamate kinase  43.93 
 
 
309 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.375863  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1665  carbamate kinase  43.09 
 
 
313 aa  218  7e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0998  carbamate kinase  43.61 
 
 
309 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4750  carbamate kinase  41.56 
 
 
310 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4813  carbamate kinase  41.56 
 
 
310 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.42996  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4868  carbamate kinase  41.56 
 
 
310 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4720  carbamate kinase  41.56 
 
 
310 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4895  carbamate kinase  41.14 
 
 
320 aa  215  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.428226  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0475  carbamate kinase  41.14 
 
 
320 aa  215  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0344  carbamate kinase  40.82 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2426  carbamate kinase  42.39 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4849  carbamate kinase  41.56 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0410  carbamate kinase  40.82 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00340879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0423  carbamate kinase  40.82 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2386  carbamate kinase  42.53 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0668132  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0183  carbamate kinase  40.84 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1620  carbamate kinase  40.32 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1966  carbamate kinase  42.53 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1984  carbamate kinase  42.53 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193138  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3444  carbamate kinase  40.38 
 
 
312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02546  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1147  carbamate kinase  42.53 
 
 
312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.506597  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2126  carbamate kinase  42.53 
 
 
312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.118318  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2319  carbamate kinase  38.54 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1587  carbamate kinase  42.53 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0246  carbamate kinase  42.53 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264579  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0913  carbamate kinase  42.53 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2650  carbamate kinase  39.05 
 
 
313 aa  212  7.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1389  carbamate kinase  41.88 
 
 
314 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373109  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1838  carbamate kinase  41.03 
 
 
301 aa  211  1e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.955077  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1878  carbamate kinase  39.61 
 
 
316 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2656  carbamate kinase  38.8 
 
 
322 aa  209  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.168651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2712  carbamate kinase  38.8 
 
 
322 aa  209  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2318  carbamate kinase  39.75 
 
 
314 aa  209  7e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3141  putative carbamate kinase  42.72 
 
 
316 aa  209  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463314  normal  0.769623 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1228  carbamate kinase  39.87 
 
 
311 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1253  carbamate kinase  39.87 
 
 
311 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.661641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0451  carbamate kinase  40.91 
 
 
303 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0361431 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2359  carbamate kinase  41.5 
 
 
301 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2409  carbamate kinase  41.5 
 
 
301 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2352  carbamate kinase  39.55 
 
 
310 aa  206  5e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1145  carbamate kinase  41.75 
 
 
300 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.986133  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0242  carbamate kinase  40.44 
 
 
313 aa  204  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000109106  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4648  carbamate kinase  40.85 
 
 
302 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0673  carbamate kinase  39.1 
 
 
317 aa  202  7e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000329636 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0748  carbamate kinase  43.75 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0269  carbamate kinase  39.81 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000010285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0388  putative carbamate kinase  43.35 
 
 
316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.662634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2798  Carbamate kinase  40.32 
 
 
311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00471  predicted carbamate kinase  40.46 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2848  carbamate kinase  44.73 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.431073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00476  hypothetical protein  40.46 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0383  putative carbamate kinase  43.04 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0595  carbamate kinase  40.46 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00468071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3101  carbamate kinase  40.46 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3300  putative carbamate kinase  43.04 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.777293  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6542  Carbamate kinase  40.85 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0353  putative carbamate kinase  43.04 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0029  carbamate kinase  39.49 
 
 
310 aa  197  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>