142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2848 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2848  carbamate kinase  100 
 
 		 313 aa  625  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.431073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2117  carbamate kinase  55.77 
 
 		 312 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.43365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4199  carbamate kinase  54.63 
 
 		 318 aa  349  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169191 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03712  Carbamate kinase-like protein yahI  54.95 
 
 		 346 aa  348  5e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03661  hypothetical protein  54.95 
 
 		 366 aa  348  9e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1927  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  49.84 
 
 		 312 aa  317  1e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0219816  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1788  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  49.52 
 
 		 311 aa  309  2.9999999999999997e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0069  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  46.28 
 
 		 313 aa  296  3e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2167  carbamate kinase  49.35 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0485  carbamate kinase  50 
 
 		 313 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000618454  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0039  carbamate kinase  49.03 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06680  carbamate kinase  49.68 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0383  putative carbamate kinase  50.95 
 
 		 316 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3141  putative carbamate kinase  50.79 
 
 		 316 aa  289  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463314  normal  0.769623 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0247  carbamate kinase  47.9 
 
 		 314 aa  288  7e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0341  putative carbamate kinase  50.79 
 
 		 316 aa  287  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0353  putative carbamate kinase  51.27 
 
 		 316 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1948  carbamate kinase  46.79 
 
 		 314 aa  287  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.572312  hitchhiker  0.000272947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1820  carbamate kinase  47.62 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3300  putative carbamate kinase  50.79 
 
 		 316 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.777293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0388  putative carbamate kinase  50.95 
 
 		 316 aa  287  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.662634 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00278  predicted carbamate kinase-like protein  50.79 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00282  hypothetical protein  50.79 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3283  Carbamate kinase  50.32 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0183  carbamate kinase  48.41 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0164  carbamate kinase  48.24 
 
 		 314 aa  278  9e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06560  carbamate kinase  48.87 
 
 		 319 aa  278  1e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.298804 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0160  carbamate kinase  47.92 
 
 		 314 aa  276  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0673  carbamate kinase  49.05 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000329636 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0242  carbamate kinase  47.15 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000109106  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2650  carbamate kinase  44.52 
 
 		 313 aa  268  1e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0679  carbamate kinase  47.28 
 
 		 317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.378738 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1947  carbamate kinase  47.28 
 
 		 317 aa  265  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal  0.423275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02707  predicted amino acid kinase  48.73 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0818  carbamate kinase  48.73 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3034  carbamate kinase  48.73 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02669  hypothetical protein  48.73 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0834  carbamate kinase  48.73 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3007  carbamate kinase  48.73 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1429  carbamate kinase  46.35 
 
 		 310 aa  261  8e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4164  carbamate kinase  48.42 
 
 		 310 aa  261  8e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3199  carbamate kinase  48.42 
 
 		 310 aa  261  8e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1665  carbamate kinase  46.2 
 
 		 313 aa  261  8.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00850  carbamate kinase  49.04 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02380  carbamate kinase  46.96 
 
 		 317 aa  259  4e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.720538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1228  carbamate kinase  43.31 
 
 		 311 aa  258  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1253  carbamate kinase  43.31 
 
 		 311 aa  258  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.661641  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3444  carbamate kinase  43.04 
 
 		 312 aa  258  9e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02546  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0651  carbamate kinase  43.35 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0426  carbamate kinase  48.09 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0351  carbamate kinase  44.37 
 
 		 321 aa  256  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2318  carbamate kinase  46.06 
 
 		 314 aa  255  7e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0423  carbamate kinase  44.37 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0410  carbamate kinase  44.37 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00340879 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0344  carbamate kinase  44.37 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0475  carbamate kinase  44.37 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331437  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0787  carbamate kinase  44.76 
 
 		 312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1878  carbamate kinase  45.95 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4895  carbamate kinase  44.37 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.428226  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2476  carbamate kinase  46.71 
 
 		 309 aa  251  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0269  carbamate kinase  47.4 
 
 		 318 aa  249  4e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000010285  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1504  carbamate kinase  47.91 
 
 		 323 aa  249  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521984  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2125  carbamate kinase  43.63 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2352  carbamate kinase  42.04 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12560  carbamate kinase  45.86 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6542  Carbamate kinase  45.39 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567735 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05980  carbamate kinase  46.01 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0029  carbamate kinase  45.4 
 
 		 310 aa  239  5e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2319  carbamate kinase  44.79 
 
 		 314 aa  239  5e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1838  carbamate kinase  42.07 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.955077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2214  aspartate/glutamate/uridylate kinase  46.44 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.350348  normal  0.825943 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2409  carbamate kinase  43.37 
 
 		 301 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2359  carbamate kinase  43.37 
 
 		 301 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0529  carbamate kinase  43.51 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0182  aspartate/glutamate/uridylate kinase  47.25 
 
 		 341 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0047  carbamate kinase  44.73 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1620  carbamate kinase  42.95 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2798  Carbamate kinase  43.51 
 
 		 311 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2656  carbamate kinase  39.81 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.168651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2712  carbamate kinase  39.81 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2426  carbamate kinase  43.41 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1145  carbamate kinase  43.51 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.986133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1389  carbamate kinase  43.04 
 
 		 314 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373109  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4750  carbamate kinase  44.01 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4813  carbamate kinase  44.01 
 
 		 310 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.42996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4868  carbamate kinase  44.01 
 
 		 310 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4720  carbamate kinase  44.01 
 
 		 310 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5913  carbamate kinase  42.58 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4849  carbamate kinase  44.01 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68350  carbamate kinase  42.58 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.221419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0998  carbamate kinase  42.39 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0451  carbamate kinase  43.55 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0361431 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6441  carbamate kinase  41.75 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841619  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4225  carbamate kinase  42.39 
 
 		 309 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.375863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0172  carbamate kinase  40.71 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1036  carbamate kinase  42.07 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873124  normal  0.536796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0999  carbamate kinase  42.07 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.782851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1984  carbamate kinase  41.8 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193138  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0659  carbamate kinase  43.77 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2126  carbamate kinase  41.83 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.118318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>