143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6441 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6441  carbamate kinase  100 
 
 
312 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841619  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68350  carbamate kinase  79.61 
 
 
310 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.221419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5913  carbamate kinase  79.61 
 
 
310 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2126  carbamate kinase  79.87 
 
 
312 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.118318  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1984  carbamate kinase  79.87 
 
 
313 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193138  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1147  carbamate kinase  79.55 
 
 
312 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.506597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1587  carbamate kinase  79.55 
 
 
313 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0246  carbamate kinase  79.55 
 
 
313 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264579  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1966  carbamate kinase  79.55 
 
 
313 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0913  carbamate kinase  79.55 
 
 
313 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2386  carbamate kinase  78.9 
 
 
312 aa  498  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0668132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4388  carbamate kinase  76.3 
 
 
309 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692138  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1106  carbamate kinase  77.27 
 
 
308 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0757388  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2686  carbamate kinase  76.95 
 
 
309 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0998  carbamate kinase  73.7 
 
 
309 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4225  carbamate kinase  73.7 
 
 
309 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.375863  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0999  carbamate kinase  73.05 
 
 
309 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.782851  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1036  carbamate kinase  73.38 
 
 
309 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873124  normal  0.536796 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4539  carbamate kinase  74.51 
 
 
312 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10506  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1389  carbamate kinase  64.67 
 
 
314 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373109  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2426  carbamate kinase  63.55 
 
 
318 aa  385  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5204  carbamate kinase  60.77 
 
 
324 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2177  carbamate kinase  61.79 
 
 
304 aa  373  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1875  carbamate kinase  61.26 
 
 
303 aa  350  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0748  carbamate kinase  58.5 
 
 
312 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2239  carbamate kinase  60.2 
 
 
305 aa  335  5e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126564  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4648  carbamate kinase  55.3 
 
 
302 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2359  carbamate kinase  54.97 
 
 
301 aa  319  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2409  carbamate kinase  54.97 
 
 
301 aa  319  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0451  carbamate kinase  53.36 
 
 
303 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0361431 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3187  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  50.97 
 
 
308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5577  carbamate kinase  59.8 
 
 
302 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1145  carbamate kinase  52.84 
 
 
300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.986133  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4813  carbamate kinase  51.18 
 
 
310 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.42996  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4868  carbamate kinase  51.18 
 
 
310 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4720  carbamate kinase  51.18 
 
 
310 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4750  carbamate kinase  51.18 
 
 
310 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4849  carbamate kinase  51.18 
 
 
310 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00471  predicted carbamate kinase  51.51 
 
 
297 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00476  hypothetical protein  51.51 
 
 
297 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0595  carbamate kinase  51.51 
 
 
297 aa  287  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00468071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3101  carbamate kinase  51.51 
 
 
297 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0566  carbamate kinase  51.84 
 
 
297 aa  286  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.16633  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0559  carbamate kinase  51.17 
 
 
297 aa  285  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0136389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3092  carbamate kinase  51.17 
 
 
297 aa  285  7e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0312776  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0622  carbamate kinase  51.17 
 
 
297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3874  carbamate kinase  50.83 
 
 
303 aa  282  6.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2963  carbamate kinase  53.33 
 
 
300 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0434  carbamate kinase  56 
 
 
312 aa  280  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.741665  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0583  carbamate kinase  51.94 
 
 
310 aa  279  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.692905  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0578  carbamate kinase  49.83 
 
 
297 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0250065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2798  Carbamate kinase  48.5 
 
 
311 aa  275  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0585  carbamate kinase  49.5 
 
 
297 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.130187 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0640  carbamate kinase  49.5 
 
 
297 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0580  carbamate kinase  49.5 
 
 
297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1784  Carbamate kinase  49.83 
 
 
301 aa  258  9e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00351606  normal  0.0183756 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1620  carbamate kinase  49.02 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0069  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  45.6 
 
 
313 aa  247  1e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1927  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  44.26 
 
 
312 aa  247  2e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0219816  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0485  carbamate kinase  46.3 
 
 
313 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000618454  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0172  carbamate kinase  47.35 
 
 
307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1788  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  44.59 
 
 
311 aa  242  7e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0047  carbamate kinase  46.23 
 
 
311 aa  239  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0247  carbamate kinase  44.23 
 
 
314 aa  233  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1948  carbamate kinase  43 
 
 
314 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.572312  hitchhiker  0.000272947 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0529  carbamate kinase  44.12 
 
 
298 aa  231  1e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2786  carbamate kinase  44.44 
 
 
314 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1820  carbamate kinase  43.46 
 
 
330 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2487  carbamate kinase  43.46 
 
 
314 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2650  carbamate kinase  44.59 
 
 
313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0269  carbamate kinase  43.63 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000010285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2117  carbamate kinase  42.04 
 
 
312 aa  219  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.43365  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2352  carbamate kinase  41.99 
 
 
310 aa  218  7.999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4895  carbamate kinase  42.68 
 
 
320 aa  216  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.428226  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0475  carbamate kinase  42.68 
 
 
320 aa  215  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331437  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0183  carbamate kinase  44.05 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0344  carbamate kinase  43.09 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0410  carbamate kinase  43.09 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00340879 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0351  carbamate kinase  42.99 
 
 
321 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0423  carbamate kinase  42.36 
 
 
320 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1429  carbamate kinase  43.87 
 
 
310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1228  carbamate kinase  39.87 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1253  carbamate kinase  39.87 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.661641  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0164  carbamate kinase  41.21 
 
 
314 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0659  carbamate kinase  44.12 
 
 
298 aa  212  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0039  carbamate kinase  43.83 
 
 
309 aa  212  5.999999999999999e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2167  carbamate kinase  40.97 
 
 
318 aa  211  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2125  carbamate kinase  43.09 
 
 
308 aa  210  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0160  carbamate kinase  41.53 
 
 
314 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0242  carbamate kinase  41.99 
 
 
313 aa  209  4e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000109106  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0426  carbamate kinase  41.61 
 
 
310 aa  205  9e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06680  carbamate kinase  42.17 
 
 
310 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2319  carbamate kinase  39.74 
 
 
314 aa  202  6e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2656  carbamate kinase  40.57 
 
 
322 aa  201  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.168651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2712  carbamate kinase  40.57 
 
 
322 aa  201  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_24238  carbamate kinase  41.42 
 
 
336 aa  199  6e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1665  carbamate kinase  40.32 
 
 
313 aa  198  7.999999999999999e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1878  carbamate kinase  42.95 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0651  carbamate kinase  41.48 
 
 
310 aa  197  3e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6542  Carbamate kinase  43.61 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567735 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>