145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4199 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03712  Carbamate kinase-like protein yahI  99.69 
 
 
346 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4199  carbamate kinase  100 
 
 
318 aa  641    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03661  hypothetical protein  99.69 
 
 
366 aa  640    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2117  carbamate kinase  52.23 
 
 
312 aa  335  5.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.43365  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2848  carbamate kinase  54.63 
 
 
313 aa  321  9.000000000000001e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.431073  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1927  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  45.71 
 
 
312 aa  289  4e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0219816  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1788  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  45.4 
 
 
311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0069  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  46.37 
 
 
313 aa  278  7e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06680  carbamate kinase  47.47 
 
 
310 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1948  carbamate kinase  45.98 
 
 
314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.572312  hitchhiker  0.000272947 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0039  carbamate kinase  47.74 
 
 
309 aa  271  8.000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0485  carbamate kinase  46.52 
 
 
313 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000618454  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2650  carbamate kinase  45.14 
 
 
313 aa  268  7e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4164  carbamate kinase  48.73 
 
 
310 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06560  carbamate kinase  45.14 
 
 
319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.298804 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0818  carbamate kinase  48.73 
 
 
310 aa  266  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3034  carbamate kinase  48.73 
 
 
310 aa  266  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0834  carbamate kinase  48.73 
 
 
310 aa  266  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3007  carbamate kinase  48.73 
 
 
310 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02707  predicted amino acid kinase  49.04 
 
 
310 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02669  hypothetical protein  49.04 
 
 
310 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1820  carbamate kinase  44.37 
 
 
330 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3199  carbamate kinase  48.41 
 
 
310 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0673  carbamate kinase  46.96 
 
 
317 aa  263  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000329636 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02380  carbamate kinase  44.09 
 
 
317 aa  263  4e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.720538  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0160  carbamate kinase  43.77 
 
 
314 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0242  carbamate kinase  44.79 
 
 
313 aa  261  1e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000109106  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2167  carbamate kinase  43.45 
 
 
318 aa  259  3e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0679  carbamate kinase  44.59 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.378738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0247  carbamate kinase  43.57 
 
 
314 aa  259  6e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1429  carbamate kinase  44.41 
 
 
310 aa  258  8e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1947  carbamate kinase  44.27 
 
 
317 aa  258  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal  0.423275 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0164  carbamate kinase  43.45 
 
 
314 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2476  carbamate kinase  47.28 
 
 
309 aa  256  3e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1665  carbamate kinase  45.45 
 
 
313 aa  256  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0787  carbamate kinase  43.31 
 
 
312 aa  255  8e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3141  putative carbamate kinase  48.6 
 
 
316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463314  normal  0.769623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1878  carbamate kinase  45.89 
 
 
316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0183  carbamate kinase  44.09 
 
 
310 aa  250  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00850  carbamate kinase  44.79 
 
 
319 aa  251  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3300  putative carbamate kinase  48.28 
 
 
316 aa  249  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.777293  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3283  Carbamate kinase  48.28 
 
 
316 aa  248  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0353  putative carbamate kinase  48.28 
 
 
316 aa  248  9e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0388  putative carbamate kinase  47.96 
 
 
316 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.662634 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0383  putative carbamate kinase  47.65 
 
 
316 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00278  predicted carbamate kinase-like protein  47.96 
 
 
316 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00282  hypothetical protein  47.96 
 
 
316 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0423  carbamate kinase  41.51 
 
 
320 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0344  carbamate kinase  40.88 
 
 
320 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0410  carbamate kinase  40.88 
 
 
320 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00340879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0475  carbamate kinase  40.88 
 
 
320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331437  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0341  putative carbamate kinase  46.71 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4895  carbamate kinase  41.19 
 
 
320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.428226  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0351  carbamate kinase  42.01 
 
 
321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1228  carbamate kinase  43.13 
 
 
311 aa  238  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1253  carbamate kinase  43.13 
 
 
311 aa  238  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.661641  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2352  carbamate kinase  43.95 
 
 
310 aa  237  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0426  carbamate kinase  42.95 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0651  carbamate kinase  41.8 
 
 
310 aa  230  2e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2487  carbamate kinase  41.77 
 
 
314 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2318  carbamate kinase  40.76 
 
 
314 aa  227  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0047  carbamate kinase  42.22 
 
 
311 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1838  carbamate kinase  43.06 
 
 
301 aa  223  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.955077  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2125  carbamate kinase  41.53 
 
 
308 aa  223  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2786  carbamate kinase  40.19 
 
 
314 aa  222  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3444  carbamate kinase  38.61 
 
 
312 aa  222  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02546  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2319  carbamate kinase  42.68 
 
 
314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2359  carbamate kinase  42.22 
 
 
301 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0029  carbamate kinase  39.94 
 
 
310 aa  218  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2409  carbamate kinase  42.22 
 
 
301 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0269  carbamate kinase  43.22 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000010285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6542  Carbamate kinase  43.09 
 
 
314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567735 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05980  carbamate kinase  41.32 
 
 
320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0172  carbamate kinase  44.09 
 
 
307 aa  211  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4750  carbamate kinase  42.27 
 
 
310 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4813  carbamate kinase  41.96 
 
 
310 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.42996  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4868  carbamate kinase  41.96 
 
 
310 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4720  carbamate kinase  41.96 
 
 
310 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2798  Carbamate kinase  45.04 
 
 
311 aa  208  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4849  carbamate kinase  41.64 
 
 
310 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2656  carbamate kinase  37.3 
 
 
322 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.168651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2712  carbamate kinase  37.3 
 
 
322 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12560  carbamate kinase  40.38 
 
 
321 aa  203  3e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1389  carbamate kinase  42.12 
 
 
314 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373109  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1620  carbamate kinase  40.89 
 
 
298 aa  202  5e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2214  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.56 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.350348  normal  0.825943 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0529  carbamate kinase  42.03 
 
 
298 aa  200  3e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1504  carbamate kinase  40.45 
 
 
323 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521984  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0451  carbamate kinase  40.61 
 
 
303 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0361431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1145  carbamate kinase  40.38 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.986133  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2177  carbamate kinase  41.85 
 
 
304 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1106  carbamate kinase  40.38 
 
 
308 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0757388  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3101  carbamate kinase  37.62 
 
 
309 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000494592  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6441  carbamate kinase  41.53 
 
 
312 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841619  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5913  carbamate kinase  40.26 
 
 
310 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1875  carbamate kinase  40.58 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68350  carbamate kinase  39.94 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.221419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2686  carbamate kinase  40.06 
 
 
309 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2426  carbamate kinase  39.23 
 
 
318 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0998  carbamate kinase  39.74 
 
 
309 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>