184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1389 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1389  carbamate kinase  100 
 
 
314 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373109  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2426  carbamate kinase  69.84 
 
 
318 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68350  carbamate kinase  66.67 
 
 
310 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.221419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5913  carbamate kinase  66.34 
 
 
310 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4388  carbamate kinase  65.9 
 
 
309 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692138  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1106  carbamate kinase  65.57 
 
 
308 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0757388  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1147  carbamate kinase  65.9 
 
 
312 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.506597  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2686  carbamate kinase  64.26 
 
 
309 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2126  carbamate kinase  65.9 
 
 
312 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.118318  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2386  carbamate kinase  65.57 
 
 
312 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0668132  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1587  carbamate kinase  65.9 
 
 
313 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0246  carbamate kinase  65.9 
 
 
313 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264579  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1966  carbamate kinase  65.9 
 
 
313 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1984  carbamate kinase  65.9 
 
 
313 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193138  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0913  carbamate kinase  65.9 
 
 
313 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1036  carbamate kinase  63.93 
 
 
309 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873124  normal  0.536796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0999  carbamate kinase  63.28 
 
 
309 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.782851  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6441  carbamate kinase  64.67 
 
 
312 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841619  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0998  carbamate kinase  63.28 
 
 
309 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4225  carbamate kinase  62.95 
 
 
309 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.375863  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4539  carbamate kinase  65.57 
 
 
312 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10506  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5204  carbamate kinase  60 
 
 
324 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2177  carbamate kinase  58.75 
 
 
304 aa  350  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2359  carbamate kinase  57.53 
 
 
301 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2409  carbamate kinase  57.53 
 
 
301 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4648  carbamate kinase  58.33 
 
 
302 aa  341  8e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1875  carbamate kinase  60.4 
 
 
303 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2239  carbamate kinase  59.06 
 
 
305 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126564  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1145  carbamate kinase  55.52 
 
 
300 aa  329  5.0000000000000004e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.986133  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0451  carbamate kinase  55.33 
 
 
303 aa  324  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0361431 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0748  carbamate kinase  57.53 
 
 
312 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4720  carbamate kinase  53.87 
 
 
310 aa  321  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4868  carbamate kinase  53.87 
 
 
310 aa  321  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4813  carbamate kinase  53.87 
 
 
310 aa  321  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.42996  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4750  carbamate kinase  53.54 
 
 
310 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4849  carbamate kinase  53.87 
 
 
310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00471  predicted carbamate kinase  53.69 
 
 
297 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00476  hypothetical protein  53.69 
 
 
297 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0595  carbamate kinase  53.69 
 
 
297 aa  310  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00468071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3101  carbamate kinase  53.69 
 
 
297 aa  310  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3092  carbamate kinase  53.36 
 
 
297 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0312776  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0566  carbamate kinase  53.69 
 
 
297 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.16633  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0559  carbamate kinase  53.36 
 
 
297 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0136389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0622  carbamate kinase  53.02 
 
 
297 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2798  Carbamate kinase  51.33 
 
 
311 aa  302  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5577  carbamate kinase  59.93 
 
 
302 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3187  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  50.81 
 
 
308 aa  295  9e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3874  carbamate kinase  54.36 
 
 
303 aa  293  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0578  carbamate kinase  51.86 
 
 
297 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0250065  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0583  carbamate kinase  53.44 
 
 
310 aa  289  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.692905  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0585  carbamate kinase  51.53 
 
 
297 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.130187 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0580  carbamate kinase  51.53 
 
 
297 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0640  carbamate kinase  51.53 
 
 
297 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0434  carbamate kinase  54.67 
 
 
312 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.741665  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2963  carbamate kinase  53.33 
 
 
300 aa  278  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1784  Carbamate kinase  52.51 
 
 
301 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00351606  normal  0.0183756 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1620  carbamate kinase  47.06 
 
 
298 aa  246  4e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1927  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  43.32 
 
 
312 aa  245  8e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0219816  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1788  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  43.28 
 
 
311 aa  236  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0485  carbamate kinase  43.55 
 
 
313 aa  236  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000618454  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0529  carbamate kinase  45.75 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2786  carbamate kinase  45.25 
 
 
314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0172  carbamate kinase  44.37 
 
 
307 aa  233  3e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0069  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  41.23 
 
 
313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0247  carbamate kinase  44.95 
 
 
314 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1948  carbamate kinase  43.97 
 
 
314 aa  229  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.572312  hitchhiker  0.000272947 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2487  carbamate kinase  44.59 
 
 
314 aa  225  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0344  carbamate kinase  43.63 
 
 
320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0183  carbamate kinase  42.81 
 
 
310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0410  carbamate kinase  43.63 
 
 
320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00340879 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0164  carbamate kinase  41.9 
 
 
314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4895  carbamate kinase  43.31 
 
 
320 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.428226  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0475  carbamate kinase  42.99 
 
 
320 aa  219  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331437  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1820  carbamate kinase  42.16 
 
 
330 aa  219  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0423  carbamate kinase  43.31 
 
 
320 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1878  carbamate kinase  45.66 
 
 
316 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0160  carbamate kinase  41.59 
 
 
314 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2125  carbamate kinase  40.89 
 
 
308 aa  216  4e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2167  carbamate kinase  42.17 
 
 
318 aa  215  5.9999999999999996e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2352  carbamate kinase  39.3 
 
 
310 aa  215  7e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1228  carbamate kinase  38.66 
 
 
311 aa  215  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1253  carbamate kinase  38.66 
 
 
311 aa  215  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.661641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2117  carbamate kinase  41.5 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.43365  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0351  carbamate kinase  43.13 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_24238  carbamate kinase  41.37 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0659  carbamate kinase  43.79 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0269  carbamate kinase  43.27 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000010285  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0047  carbamate kinase  41.88 
 
 
311 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2318  carbamate kinase  41.03 
 
 
314 aa  209  5e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0242  carbamate kinase  43.22 
 
 
313 aa  208  9e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000109106  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6542  Carbamate kinase  45.07 
 
 
314 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567735 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0039  carbamate kinase  42.21 
 
 
309 aa  207  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0426  carbamate kinase  41.16 
 
 
310 aa  206  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2476  carbamate kinase  42.39 
 
 
309 aa  206  5e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0645  carbamate kinase  42.16 
 
 
298 aa  206  5e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.101685  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03661  hypothetical protein  42.44 
 
 
366 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2656  carbamate kinase  40.84 
 
 
322 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.168651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2712  carbamate kinase  40.84 
 
 
322 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03712  Carbamate kinase-like protein yahI  42.44 
 
 
346 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4199  carbamate kinase  42.12 
 
 
318 aa  202  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169191 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>