173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0242 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0242  carbamate kinase  100 
 
 		 313 aa  634    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000109106  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2476  carbamate kinase  64.42 
 
 		 309 aa  393  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02707  predicted amino acid kinase  64.74 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0818  carbamate kinase  64.74 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3007  carbamate kinase  64.74 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4164  carbamate kinase  64.74 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02669  hypothetical protein  64.74 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0834  carbamate kinase  64.74 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3034  carbamate kinase  64.74 
 
 		 310 aa  385  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3199  carbamate kinase  64.42 
 
 		 310 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06680  carbamate kinase  62.66 
 
 		 310 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2650  carbamate kinase  62.26 
 
 		 313 aa  368  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1665  carbamate kinase  59.16 
 
 		 313 aa  358  6e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0183  carbamate kinase  58.47 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0787  carbamate kinase  58.47 
 
 		 312 aa  338  5e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0164  carbamate kinase  53.48 
 
 		 314 aa  329  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06560  carbamate kinase  54.19 
 
 		 319 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.298804 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0160  carbamate kinase  53.48 
 
 		 314 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1429  carbamate kinase  56.09 
 
 		 310 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0485  carbamate kinase  55.84 
 
 		 313 aa  324  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000618454  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3444  carbamate kinase  52.75 
 
 		 312 aa  322  5e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02546  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0673  carbamate kinase  51.94 
 
 		 317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000329636 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0029  carbamate kinase  52.9 
 
 		 310 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0679  carbamate kinase  54.52 
 
 		 317 aa  311  9e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.378738 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0651  carbamate kinase  52.29 
 
 		 310 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0426  carbamate kinase  51.46 
 
 		 310 aa  305  5.0000000000000004e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02380  carbamate kinase  52.41 
 
 		 317 aa  305  6e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.720538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1947  carbamate kinase  52.9 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal  0.423275 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00850  carbamate kinase  52.73 
 
 		 319 aa  302  5.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05980  carbamate kinase  51.92 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2352  carbamate kinase  49.03 
 
 		 310 aa  299  3e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1228  carbamate kinase  49.52 
 
 		 311 aa  298  8e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1253  carbamate kinase  49.52 
 
 		 311 aa  298  8e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.661641  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0269  carbamate kinase  51.58 
 
 		 318 aa  298  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000010285  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12560  carbamate kinase  51.58 
 
 		 321 aa  297  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2125  carbamate kinase  51.95 
 
 		 308 aa  297  2e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0475  carbamate kinase  50.64 
 
 		 320 aa  294  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4895  carbamate kinase  49.68 
 
 		 320 aa  292  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.428226  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0423  carbamate kinase  50 
 
 		 320 aa  292  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0351  carbamate kinase  50.64 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0344  carbamate kinase  49.36 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0410  carbamate kinase  49.36 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00340879 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2117  carbamate kinase  49.38 
 
 		 312 aa  289  5.0000000000000004e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.43365  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2167  carbamate kinase  49.36 
 
 		 318 aa  287  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0069  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  48.73 
 
 		 313 aa  285  7e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3101  carbamate kinase  48.21 
 
 		 309 aa  275  8e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000494592  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1948  carbamate kinase  44.94 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.572312  hitchhiker  0.000272947 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0039  carbamate kinase  49.2 
 
 		 309 aa  265  7e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1927  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  47.84 
 
 		 312 aa  263  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0219816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03712  Carbamate kinase-like protein yahI  45.11 
 
 		 346 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03661  hypothetical protein  45.11 
 
 		 366 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4199  carbamate kinase  44.79 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169191 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0247  carbamate kinase  44.27 
 
 		 314 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2656  carbamate kinase  44.03 
 
 		 322 aa  258  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.168651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2712  carbamate kinase  44.03 
 
 		 322 aa  258  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1788  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  46.75 
 
 		 311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2848  carbamate kinase  47.15 
 
 		 313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.431073  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf130  carbamate kinase  47.91 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1878  carbamate kinase  41.88 
 
 		 316 aa  235  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1838  carbamate kinase  41.53 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.955077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2318  carbamate kinase  42.9 
 
 		 314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2359  carbamate kinase  43.45 
 
 		 301 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2409  carbamate kinase  43.45 
 
 		 301 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3141  putative carbamate kinase  45.28 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463314  normal  0.769623 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2319  carbamate kinase  43.89 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0383  putative carbamate kinase  45.91 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0353  putative carbamate kinase  45.6 
 
 		 316 aa  226  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0341  putative carbamate kinase  45.14 
 
 		 316 aa  225  7e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0388  putative carbamate kinase  45.28 
 
 		 316 aa  225  9e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.662634 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3300  putative carbamate kinase  44.97 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.777293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2426  carbamate kinase  44.44 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3283  Carbamate kinase  44.97 
 
 		 316 aa  222  6e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00278  predicted carbamate kinase-like protein  44.97 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00282  hypothetical protein  44.97 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0999  carbamate kinase  44.09 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.782851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1036  carbamate kinase  44.09 
 
 		 309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873124  normal  0.536796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1106  carbamate kinase  44.79 
 
 		 308 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0757388  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0998  carbamate kinase  44.09 
 
 		 309 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4225  carbamate kinase  43.77 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.375863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1820  carbamate kinase  40.19 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4750  carbamate kinase  43.49 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4720  carbamate kinase  43.49 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4868  carbamate kinase  43.49 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4813  carbamate kinase  43.49 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.42996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4849  carbamate kinase  43.49 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6441  carbamate kinase  41.99 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841619  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5913  carbamate kinase  43.35 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2786  carbamate kinase  43.04 
 
 		 314 aa  209  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1389  carbamate kinase  43.22 
 
 		 314 aa  208  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373109  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2487  carbamate kinase  41.38 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68350  carbamate kinase  42.72 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.221419 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0451  carbamate kinase  43.63 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0361431 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0172  carbamate kinase  40.45 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1145  carbamate kinase  42.36 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.986133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4388  carbamate kinase  42.49 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692138  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1620  carbamate kinase  39.55 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4648  carbamate kinase  41.72 
 
 		 302 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1504  carbamate kinase  41.21 
 
 		 323 aa  205  9e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0047  carbamate kinase  40.44 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2686  carbamate kinase  41.53 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>