142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1504 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1504  carbamate kinase  100 
 
 
323 aa  628  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521984  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1878  carbamate kinase  68.39 
 
 
316 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0182  aspartate/glutamate/uridylate kinase  64.08 
 
 
341 aa  338  5e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6542  Carbamate kinase  61.89 
 
 
314 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567735 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2214  aspartate/glutamate/uridylate kinase  61.62 
 
 
300 aa  318  6e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.350348  normal  0.825943 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1948  carbamate kinase  47.4 
 
 
314 aa  269  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.572312  hitchhiker  0.000272947 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0247  carbamate kinase  46.43 
 
 
314 aa  265  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0485  carbamate kinase  43.87 
 
 
313 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000618454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2117  carbamate kinase  43.69 
 
 
312 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.43365  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1788  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  42.86 
 
 
311 aa  253  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0351  carbamate kinase  41.61 
 
 
321 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0069  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  39.87 
 
 
313 aa  248  1e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2848  carbamate kinase  47.91 
 
 
313 aa  245  8e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.431073  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1820  carbamate kinase  43.32 
 
 
330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1927  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  40.78 
 
 
312 aa  242  5e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0219816  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2167  carbamate kinase  41.07 
 
 
318 aa  241  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0475  carbamate kinase  40.97 
 
 
320 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0344  carbamate kinase  41.29 
 
 
320 aa  239  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0410  carbamate kinase  41.29 
 
 
320 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00340879 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4895  carbamate kinase  40.97 
 
 
320 aa  238  8e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.428226  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2426  carbamate kinase  48.72 
 
 
318 aa  238  9e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0164  carbamate kinase  41.72 
 
 
314 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0423  carbamate kinase  40.97 
 
 
320 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0160  carbamate kinase  41.4 
 
 
314 aa  236  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0039  carbamate kinase  43.13 
 
 
309 aa  235  9e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0673  carbamate kinase  41.72 
 
 
317 aa  232  5e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000329636 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3444  carbamate kinase  40.58 
 
 
312 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02546  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06560  carbamate kinase  42.04 
 
 
319 aa  229  4e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.298804 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2656  carbamate kinase  39.55 
 
 
322 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.168651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2712  carbamate kinase  39.55 
 
 
322 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1429  carbamate kinase  41.72 
 
 
310 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0818  carbamate kinase  42.81 
 
 
310 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3034  carbamate kinase  42.81 
 
 
310 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3199  carbamate kinase  42.81 
 
 
310 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0834  carbamate kinase  42.81 
 
 
310 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3007  carbamate kinase  42.81 
 
 
310 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4164  carbamate kinase  42.49 
 
 
310 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02707  predicted amino acid kinase  42.49 
 
 
310 aa  222  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02669  hypothetical protein  42.49 
 
 
310 aa  222  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2319  carbamate kinase  41.69 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2786  carbamate kinase  44.34 
 
 
314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0242  carbamate kinase  41.21 
 
 
313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000109106  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0269  carbamate kinase  42.68 
 
 
318 aa  219  7e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000010285  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0183  carbamate kinase  39.23 
 
 
310 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2409  carbamate kinase  43.91 
 
 
301 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2359  carbamate kinase  43.91 
 
 
301 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03712  Carbamate kinase-like protein yahI  40.76 
 
 
346 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1838  carbamate kinase  41.64 
 
 
301 aa  218  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.955077  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03661  hypothetical protein  40.76 
 
 
366 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2318  carbamate kinase  41.27 
 
 
314 aa  217  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4199  carbamate kinase  40.45 
 
 
318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169191 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06680  carbamate kinase  39.94 
 
 
310 aa  215  8e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1228  carbamate kinase  36.66 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1253  carbamate kinase  36.66 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.661641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2798  Carbamate kinase  41.99 
 
 
311 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00850  carbamate kinase  42.17 
 
 
319 aa  211  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2650  carbamate kinase  39.94 
 
 
313 aa  211  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2476  carbamate kinase  39.87 
 
 
309 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0047  carbamate kinase  40.51 
 
 
311 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12560  carbamate kinase  41.14 
 
 
321 aa  210  3e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2487  carbamate kinase  43.83 
 
 
314 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0679  carbamate kinase  39.12 
 
 
317 aa  209  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.378738 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1947  carbamate kinase  39.43 
 
 
317 aa  208  8e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal  0.423275 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05980  carbamate kinase  40.06 
 
 
320 aa  208  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0388  putative carbamate kinase  41.99 
 
 
316 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.662634 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0383  putative carbamate kinase  41.67 
 
 
316 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02380  carbamate kinase  38.34 
 
 
317 aa  207  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.720538  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0353  putative carbamate kinase  41.99 
 
 
316 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3300  putative carbamate kinase  41.99 
 
 
316 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.777293  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3283  Carbamate kinase  41.99 
 
 
316 aa  206  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0341  putative carbamate kinase  41.99 
 
 
316 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3141  putative carbamate kinase  41.67 
 
 
316 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463314  normal  0.769623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00278  predicted carbamate kinase-like protein  41.67 
 
 
316 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2352  carbamate kinase  35.37 
 
 
310 aa  203  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00282  hypothetical protein  41.67 
 
 
316 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1665  carbamate kinase  38.34 
 
 
313 aa  203  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0426  carbamate kinase  38.85 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0172  carbamate kinase  41.23 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2177  carbamate kinase  42.39 
 
 
304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0651  carbamate kinase  37.11 
 
 
310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0787  carbamate kinase  36.94 
 
 
312 aa  198  7.999999999999999e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2125  carbamate kinase  36.89 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0029  carbamate kinase  37.5 
 
 
310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1389  carbamate kinase  43.69 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373109  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1620  carbamate kinase  40.51 
 
 
298 aa  196  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0529  carbamate kinase  41.75 
 
 
298 aa  194  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4388  carbamate kinase  42.39 
 
 
309 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692138  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4225  carbamate kinase  41.42 
 
 
309 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.375863  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1036  carbamate kinase  40.78 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873124  normal  0.536796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0999  carbamate kinase  40.78 
 
 
309 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.782851  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1106  carbamate kinase  41.94 
 
 
308 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0757388  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2686  carbamate kinase  41.1 
 
 
309 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2963  carbamate kinase  43.73 
 
 
300 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6441  carbamate kinase  42.72 
 
 
312 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841619  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0998  carbamate kinase  40.78 
 
 
309 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf130  carbamate kinase  39.43 
 
 
312 aa  186  5e-46  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4648  carbamate kinase  41.42 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5913  carbamate kinase  41.29 
 
 
310 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68350  carbamate kinase  41.29 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.221419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1875  carbamate kinase  42.12 
 
 
303 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>