169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0160 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0160  carbamate kinase  100 
 
 
314 aa  632  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0164  carbamate kinase  97.13 
 
 
314 aa  615  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06680  carbamate kinase  58.52 
 
 
310 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3199  carbamate kinase  55.27 
 
 
310 aa  341  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0485  carbamate kinase  56.91 
 
 
313 aa  340  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000618454  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0818  carbamate kinase  54.95 
 
 
310 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4164  carbamate kinase  54.95 
 
 
310 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3007  carbamate kinase  54.95 
 
 
310 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3034  carbamate kinase  54.95 
 
 
310 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0834  carbamate kinase  54.95 
 
 
310 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0183  carbamate kinase  56.55 
 
 
310 aa  339  4e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02707  predicted amino acid kinase  54.63 
 
 
310 aa  338  8e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02669  hypothetical protein  54.63 
 
 
310 aa  338  8e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0787  carbamate kinase  58.2 
 
 
312 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0269  carbamate kinase  56.45 
 
 
318 aa  333  2e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000010285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3444  carbamate kinase  54.92 
 
 
312 aa  331  9e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02546  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2476  carbamate kinase  56.27 
 
 
309 aa  330  3e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1429  carbamate kinase  53.7 
 
 
310 aa  328  7e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0242  carbamate kinase  53.48 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000109106  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1665  carbamate kinase  53.67 
 
 
313 aa  319  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0651  carbamate kinase  51.12 
 
 
310 aa  317  2e-85  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0029  carbamate kinase  55.13 
 
 
310 aa  316  4e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2650  carbamate kinase  54.29 
 
 
313 aa  315  8e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06560  carbamate kinase  50.64 
 
 
319 aa  314  9.999999999999999e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.298804 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0475  carbamate kinase  52.08 
 
 
320 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4895  carbamate kinase  51.76 
 
 
320 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.428226  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0673  carbamate kinase  50.8 
 
 
317 aa  311  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000329636 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2167  carbamate kinase  51.27 
 
 
318 aa  310  2e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0351  carbamate kinase  52.41 
 
 
321 aa  310  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0426  carbamate kinase  53.7 
 
 
310 aa  309  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0423  carbamate kinase  52.08 
 
 
320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0344  carbamate kinase  51.12 
 
 
320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0410  carbamate kinase  51.12 
 
 
320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00340879 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0069  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  48.55 
 
 
313 aa  307  2.0000000000000002e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02380  carbamate kinase  49.2 
 
 
317 aa  306  4.0000000000000004e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.720538  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1228  carbamate kinase  50.96 
 
 
311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1253  carbamate kinase  50.96 
 
 
311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.661641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1947  carbamate kinase  48.55 
 
 
317 aa  300  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal  0.423275 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00850  carbamate kinase  51.27 
 
 
319 aa  299  5e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2352  carbamate kinase  50.32 
 
 
310 aa  298  7e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0679  carbamate kinase  48.06 
 
 
317 aa  297  1e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.378738 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1788  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  49.35 
 
 
311 aa  296  4e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2125  carbamate kinase  51.76 
 
 
308 aa  294  1e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2656  carbamate kinase  48.72 
 
 
322 aa  292  6e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.168651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2712  carbamate kinase  48.72 
 
 
322 aa  292  6e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1927  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  48.55 
 
 
312 aa  291  7e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0219816  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0247  carbamate kinase  46.95 
 
 
314 aa  289  4e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2117  carbamate kinase  48.06 
 
 
312 aa  288  9e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.43365  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1948  carbamate kinase  46.2 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.572312  hitchhiker  0.000272947 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12560  carbamate kinase  48.57 
 
 
321 aa  278  1e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05980  carbamate kinase  47.94 
 
 
320 aa  271  9e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0039  carbamate kinase  48.4 
 
 
309 aa  266  4e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03712  Carbamate kinase-like protein yahI  44.09 
 
 
346 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03661  hypothetical protein  44.09 
 
 
366 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4199  carbamate kinase  43.77 
 
 
318 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169191 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2318  carbamate kinase  47.3 
 
 
314 aa  260  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2319  carbamate kinase  45.71 
 
 
314 aa  255  6e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1838  carbamate kinase  43.31 
 
 
301 aa  249  4e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.955077  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf130  carbamate kinase  45.06 
 
 
312 aa  248  1e-64  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2848  carbamate kinase  47.92 
 
 
313 aa  246  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.431073  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3141  putative carbamate kinase  46.82 
 
 
316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463314  normal  0.769623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1820  carbamate kinase  41.94 
 
 
330 aa  245  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1878  carbamate kinase  40.63 
 
 
316 aa  242  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0383  putative carbamate kinase  46.98 
 
 
316 aa  242  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3300  putative carbamate kinase  46.18 
 
 
316 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.777293  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0388  putative carbamate kinase  45.86 
 
 
316 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.662634 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0353  putative carbamate kinase  46.03 
 
 
316 aa  238  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00278  predicted carbamate kinase-like protein  46.18 
 
 
316 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3283  Carbamate kinase  46.18 
 
 
316 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00282  hypothetical protein  46.18 
 
 
316 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0341  putative carbamate kinase  46.03 
 
 
316 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0047  carbamate kinase  41.21 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1620  carbamate kinase  41.85 
 
 
298 aa  233  3e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1106  carbamate kinase  44.87 
 
 
308 aa  232  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0757388  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3101  carbamate kinase  44.52 
 
 
309 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000494592  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0998  carbamate kinase  43.77 
 
 
309 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4225  carbamate kinase  43.45 
 
 
309 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.375863  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4868  carbamate kinase  43.87 
 
 
310 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4720  carbamate kinase  43.87 
 
 
310 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4813  carbamate kinase  43.87 
 
 
310 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.42996  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4750  carbamate kinase  43.55 
 
 
310 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2177  carbamate kinase  41.4 
 
 
304 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0999  carbamate kinase  43.45 
 
 
309 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.782851  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2239  carbamate kinase  43.73 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126564  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4849  carbamate kinase  43.55 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1036  carbamate kinase  43.45 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873124  normal  0.536796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2409  carbamate kinase  43.17 
 
 
301 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2359  carbamate kinase  43.17 
 
 
301 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5913  carbamate kinase  42.99 
 
 
310 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68350  carbamate kinase  42.99 
 
 
310 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.221419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1389  carbamate kinase  41.59 
 
 
314 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373109  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2426  carbamate kinase  42.68 
 
 
318 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0529  carbamate kinase  39.42 
 
 
298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2686  carbamate kinase  42.81 
 
 
309 aa  215  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1504  carbamate kinase  41.4 
 
 
323 aa  215  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4388  carbamate kinase  42.49 
 
 
309 aa  215  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692138  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1145  carbamate kinase  42.49 
 
 
300 aa  215  8e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.986133  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0451  carbamate kinase  42.9 
 
 
303 aa  215  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0361431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1875  carbamate kinase  42.36 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2786  carbamate kinase  39.87 
 
 
314 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>