143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00476 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00471  predicted carbamate kinase  100 
 
 
297 aa  598  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00476  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  598  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0595  carbamate kinase  100 
 
 
297 aa  598  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00468071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3101  carbamate kinase  100 
 
 
297 aa  598  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3092  carbamate kinase  99.33 
 
 
297 aa  595  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0312776  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0559  carbamate kinase  98.99 
 
 
297 aa  593  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0136389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0622  carbamate kinase  98.99 
 
 
297 aa  592  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0566  carbamate kinase  98.32 
 
 
297 aa  588  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.16633  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0585  carbamate kinase  87.21 
 
 
297 aa  524  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.130187 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0640  carbamate kinase  87.21 
 
 
297 aa  524  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0578  carbamate kinase  87.54 
 
 
297 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0250065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0580  carbamate kinase  86.87 
 
 
297 aa  520  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4813  carbamate kinase  56.23 
 
 
310 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.42996  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4868  carbamate kinase  56.23 
 
 
310 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4720  carbamate kinase  56.23 
 
 
310 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4750  carbamate kinase  55.89 
 
 
310 aa  315  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4849  carbamate kinase  56.23 
 
 
310 aa  315  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0451  carbamate kinase  56.23 
 
 
303 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0361431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1389  carbamate kinase  53.69 
 
 
314 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373109  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1106  carbamate kinase  55.37 
 
 
308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0757388  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4225  carbamate kinase  54.03 
 
 
309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.375863  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0998  carbamate kinase  53.69 
 
 
309 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1036  carbamate kinase  53.02 
 
 
309 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873124  normal  0.536796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0999  carbamate kinase  52.68 
 
 
309 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.782851  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2426  carbamate kinase  53.54 
 
 
318 aa  296  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68350  carbamate kinase  52.17 
 
 
310 aa  292  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.221419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2239  carbamate kinase  53.85 
 
 
305 aa  292  5e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126564  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5913  carbamate kinase  52.17 
 
 
310 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2177  carbamate kinase  54.85 
 
 
304 aa  291  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6441  carbamate kinase  51.51 
 
 
312 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841619  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1145  carbamate kinase  52.36 
 
 
300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.986133  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2686  carbamate kinase  51.34 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4388  carbamate kinase  52.01 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692138  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5204  carbamate kinase  52.33 
 
 
324 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2409  carbamate kinase  48.99 
 
 
301 aa  278  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2359  carbamate kinase  48.99 
 
 
301 aa  278  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4648  carbamate kinase  52.82 
 
 
302 aa  277  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1587  carbamate kinase  49.67 
 
 
313 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0246  carbamate kinase  49.67 
 
 
313 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1984  carbamate kinase  49.67 
 
 
313 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193138  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0913  carbamate kinase  49.67 
 
 
313 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1966  carbamate kinase  49.67 
 
 
313 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2126  carbamate kinase  49.83 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.118318  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1147  carbamate kinase  49.83 
 
 
312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.506597  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2386  carbamate kinase  49.66 
 
 
312 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0668132  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3187  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  48.48 
 
 
308 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3874  carbamate kinase  50.83 
 
 
303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2963  carbamate kinase  50.51 
 
 
300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2798  Carbamate kinase  46.64 
 
 
311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0583  carbamate kinase  52.68 
 
 
310 aa  252  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.692905  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4539  carbamate kinase  50 
 
 
312 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10506  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1875  carbamate kinase  52 
 
 
303 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0748  carbamate kinase  49.16 
 
 
312 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0434  carbamate kinase  52.01 
 
 
312 aa  245  6e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.741665  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1784  Carbamate kinase  49.32 
 
 
301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00351606  normal  0.0183756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1927  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  44.01 
 
 
312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0219816  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0247  carbamate kinase  45.98 
 
 
314 aa  231  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0172  carbamate kinase  45.97 
 
 
307 aa  230  3e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1620  carbamate kinase  44.48 
 
 
298 aa  227  2e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0529  carbamate kinase  43.81 
 
 
298 aa  223  3e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2786  carbamate kinase  42.95 
 
 
314 aa  221  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0069  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  40.13 
 
 
313 aa  221  9e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1788  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  42.72 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1948  carbamate kinase  43.32 
 
 
314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.572312  hitchhiker  0.000272947 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_24238  carbamate kinase  43.97 
 
 
336 aa  213  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5577  carbamate kinase  49.5 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0659  carbamate kinase  45.15 
 
 
298 aa  212  7e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2487  carbamate kinase  41.64 
 
 
314 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0485  carbamate kinase  43.04 
 
 
313 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000618454  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1838  carbamate kinase  39.6 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.955077  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0047  carbamate kinase  40.46 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0160  carbamate kinase  42.26 
 
 
314 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1820  carbamate kinase  41.56 
 
 
330 aa  195  9e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0164  carbamate kinase  41.48 
 
 
314 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2318  carbamate kinase  39.94 
 
 
314 aa  191  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0039  carbamate kinase  42.62 
 
 
309 aa  191  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0269  carbamate kinase  43.13 
 
 
318 aa  190  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000010285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4895  carbamate kinase  41.61 
 
 
320 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.428226  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0423  carbamate kinase  41.61 
 
 
320 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0475  carbamate kinase  41.29 
 
 
320 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0344  carbamate kinase  41.29 
 
 
320 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1878  carbamate kinase  41.53 
 
 
316 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0410  carbamate kinase  41.29 
 
 
320 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00340879 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0351  carbamate kinase  42.44 
 
 
321 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2117  carbamate kinase  38.11 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.43365  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0242  carbamate kinase  41.08 
 
 
313 aa  183  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000109106  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03661  hypothetical protein  39.1 
 
 
366 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4199  carbamate kinase  38.78 
 
 
318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169191 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03712  Carbamate kinase-like protein yahI  39.1 
 
 
346 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2650  carbamate kinase  38.41 
 
 
313 aa  182  7e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0645  carbamate kinase  40.47 
 
 
298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.101685  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0029  carbamate kinase  39.3 
 
 
310 aa  178  8e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2125  carbamate kinase  38.14 
 
 
308 aa  176  5e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2319  carbamate kinase  37.74 
 
 
314 aa  175  8e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02707  predicted amino acid kinase  39.74 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02669  hypothetical protein  39.74 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4164  carbamate kinase  39.74 
 
 
310 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3199  carbamate kinase  39.74 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0818  carbamate kinase  39.74 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3007  carbamate kinase  39.74 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>