152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3874 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3874  carbamate kinase  100 
 
 
303 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4648  carbamate kinase  71.85 
 
 
302 aa  421  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2239  carbamate kinase  63.58 
 
 
305 aa  361  7.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126564  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1389  carbamate kinase  54.36 
 
 
314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373109  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2426  carbamate kinase  54.7 
 
 
318 aa  316  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5913  carbamate kinase  54.97 
 
 
310 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68350  carbamate kinase  54.97 
 
 
310 aa  315  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.221419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2686  carbamate kinase  53.49 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1036  carbamate kinase  52.81 
 
 
309 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873124  normal  0.536796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4388  carbamate kinase  52.82 
 
 
309 aa  309  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692138  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1106  carbamate kinase  53.64 
 
 
308 aa  309  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0757388  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0998  carbamate kinase  52.81 
 
 
309 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4225  carbamate kinase  53.16 
 
 
309 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.375863  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0999  carbamate kinase  52.15 
 
 
309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.782851  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2359  carbamate kinase  52.68 
 
 
301 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2409  carbamate kinase  52.68 
 
 
301 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1966  carbamate kinase  53.47 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1984  carbamate kinase  53.47 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193138  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2126  carbamate kinase  53.47 
 
 
312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.118318  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2386  carbamate kinase  53.14 
 
 
312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0668132  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6441  carbamate kinase  50.83 
 
 
312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841619  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1587  carbamate kinase  53.47 
 
 
313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0246  carbamate kinase  53.47 
 
 
313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264579  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0913  carbamate kinase  53.47 
 
 
313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1147  carbamate kinase  53.47 
 
 
312 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.506597  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5204  carbamate kinase  52.15 
 
 
324 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1145  carbamate kinase  53.02 
 
 
300 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.986133  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2177  carbamate kinase  51.32 
 
 
304 aa  289  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4720  carbamate kinase  51.5 
 
 
310 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4868  carbamate kinase  51.5 
 
 
310 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4813  carbamate kinase  51.5 
 
 
310 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.42996  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4750  carbamate kinase  51.5 
 
 
310 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0434  carbamate kinase  57.86 
 
 
312 aa  287  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.741665  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4849  carbamate kinase  51.16 
 
 
310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0451  carbamate kinase  50.5 
 
 
303 aa  279  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0361431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2798  Carbamate kinase  49.67 
 
 
311 aa  278  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0566  carbamate kinase  51.5 
 
 
297 aa  277  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.16633  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00476  hypothetical protein  50.83 
 
 
297 aa  275  5e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766873  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00471  predicted carbamate kinase  50.83 
 
 
297 aa  275  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0595  carbamate kinase  50.83 
 
 
297 aa  275  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00468071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3101  carbamate kinase  50.83 
 
 
297 aa  275  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3092  carbamate kinase  50.83 
 
 
297 aa  275  6e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0312776  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4539  carbamate kinase  53.8 
 
 
312 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10506  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1784  Carbamate kinase  55.03 
 
 
301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00351606  normal  0.0183756 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0622  carbamate kinase  50.5 
 
 
297 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0559  carbamate kinase  50.17 
 
 
297 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0136389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1875  carbamate kinase  52.81 
 
 
303 aa  269  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0748  carbamate kinase  49.34 
 
 
312 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0578  carbamate kinase  49.5 
 
 
297 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0250065  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0640  carbamate kinase  49.17 
 
 
297 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0580  carbamate kinase  49.17 
 
 
297 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0585  carbamate kinase  49.17 
 
 
297 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.130187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3187  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  47.02 
 
 
308 aa  259  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0485  carbamate kinase  45.34 
 
 
313 aa  248  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000618454  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2963  carbamate kinase  50.83 
 
 
300 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1948  carbamate kinase  46.23 
 
 
314 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.572312  hitchhiker  0.000272947 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1927  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  44.22 
 
 
312 aa  246  4e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0219816  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1620  carbamate kinase  43.09 
 
 
298 aa  241  1e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0172  carbamate kinase  46.36 
 
 
307 aa  237  2e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1788  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  43.89 
 
 
311 aa  236  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5577  carbamate kinase  51.33 
 
 
302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0583  carbamate kinase  49.16 
 
 
310 aa  232  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.692905  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0069  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  43 
 
 
313 aa  232  5e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0529  carbamate kinase  43.42 
 
 
298 aa  230  3e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0247  carbamate kinase  44.98 
 
 
314 aa  229  6e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0351  carbamate kinase  44.23 
 
 
321 aa  218  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1228  carbamate kinase  41.1 
 
 
311 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1253  carbamate kinase  41.1 
 
 
311 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.661641  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0164  carbamate kinase  43.27 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0160  carbamate kinase  42.63 
 
 
314 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0423  carbamate kinase  42.31 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4895  carbamate kinase  42.31 
 
 
320 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.428226  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0475  carbamate kinase  41.99 
 
 
320 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0344  carbamate kinase  41.99 
 
 
320 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2786  carbamate kinase  40.72 
 
 
314 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0410  carbamate kinase  41.99 
 
 
320 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00340879 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0039  carbamate kinase  43.46 
 
 
309 aa  209  6e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0269  carbamate kinase  43.95 
 
 
318 aa  209  6e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000010285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2487  carbamate kinase  41.69 
 
 
314 aa  208  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1820  carbamate kinase  42.76 
 
 
330 aa  208  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0047  carbamate kinase  42.44 
 
 
311 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2352  carbamate kinase  38.78 
 
 
310 aa  204  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2117  carbamate kinase  39.87 
 
 
312 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.43365  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0659  carbamate kinase  41.45 
 
 
298 aa  204  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06680  carbamate kinase  42.17 
 
 
310 aa  202  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2125  carbamate kinase  41.16 
 
 
308 aa  202  6e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0242  carbamate kinase  40.71 
 
 
313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000109106  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2319  carbamate kinase  40.45 
 
 
314 aa  200  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2318  carbamate kinase  42.9 
 
 
314 aa  199  6e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_24238  carbamate kinase  40.91 
 
 
336 aa  198  9e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2167  carbamate kinase  40.26 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3444  carbamate kinase  41.72 
 
 
312 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02546  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0029  carbamate kinase  41.84 
 
 
310 aa  193  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2656  carbamate kinase  39.94 
 
 
322 aa  192  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.168651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2712  carbamate kinase  39.94 
 
 
322 aa  192  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0183  carbamate kinase  39.16 
 
 
310 aa  192  5e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0645  carbamate kinase  40.13 
 
 
298 aa  192  6e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.101685  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05980  carbamate kinase  41.35 
 
 
320 aa  191  9e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1429  carbamate kinase  39.68 
 
 
310 aa  190  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1665  carbamate kinase  40.06 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>