31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0581 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0581  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 880 aa  1736    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3227  hypothetical protein  46.75 
 
 		 996 aa  598  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.640032  normal  0.507723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0366  chromosome segregation ATPase-like protein  48.39 
 
 		 1030 aa  553  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.641713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0705  conserved repeat domain protein  45.97 
 
 		 847 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.63202e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0694  conserved repeat domain protein  45.34 
 
 		 848 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0143238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3278  hypothetical protein  52.48 
 
 		 966 aa  154  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1012  hypothetical protein  37.57 
 
 		 432 aa  107  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217202  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.95 
 
 		 561 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.13 
 
 		 643 aa  67  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  34.64 
 
 		 898 aa  57.8  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.07 
 
 		 587 aa  57  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  31.67 
 
 		 258 aa  50.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1521  conserved repeat domain protein  28.07 
 
 		 435 aa  50.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000177441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  23.75 
 
 		 5010 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.06 
 
 		 453 aa  50.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  21.43 
 
 		 5017 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  31.67 
 
 		 258 aa  50.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  20.88 
 
 		 5017 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  30.65 
 
 		 269 aa  47.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  30.65 
 
 		 269 aa  47.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  30.65 
 
 		 269 aa  47.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  20.68 
 
 		 5017 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  20.68 
 
 		 5017 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  21.02 
 
 		 5017 aa  46.2  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1354  Sporulation domain protein  27.68 
 
 		 409 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.89794e-26 
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  28.15 
 
 		 488 aa  45.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2719  conserved repeat domain protein  25.1 
 
 		 435 aa  45.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1035  colicin/pyosin nuclease family protein  45.05 
 
 		 459 aa  45.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  28.15 
 
 		 488 aa  45.1  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  38.75 
 
 		 510 aa  44.7  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  21.38 
 
 		 5010 aa  44.3  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>