24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3278 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3278  hypothetical protein  100 
 
 		 966 aa  1911    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0705  conserved repeat domain protein  58.58 
 
 		 847 aa  656    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.63202e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3227  hypothetical protein  71.71 
 
 		 996 aa  981    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.640032  normal  0.507723 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0694  conserved repeat domain protein  58.58 
 
 		 848 aa  666    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0143238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0581  conserved repeat domain protein  47.08 
 
 		 880 aa  707    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0366  chromosome segregation ATPase-like protein  63.16 
 
 		 1030 aa  770    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.641713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1012  hypothetical protein  33.82 
 
 		 432 aa  97.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0936  hypothetical protein  47.69 
 
 		 801 aa  87  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.77 
 
 		 561 aa  77  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  40 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  43.56 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.67 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  32.28 
 
 		 331 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  36.98 
 
 		 1032 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  34.51 
 
 		 318 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  35.29 
 
 		 334 aa  49.7  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  30.72 
 
 		 587 aa  48.9  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.13 
 
 		 482 aa  48.5  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1514  hypothetical protein  43.48 
 
 		 660 aa  48.5  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.767692  hitchhiker  0.00000248553 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2719  conserved repeat domain protein  27.04 
 
 		 435 aa  47.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  34.59 
 
 		 330 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  29.02 
 
 		 2821 aa  45.8  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  30.77 
 
 		 333 aa  45.8  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  30.77 
 
 		 333 aa  45.8  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>