26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0705 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3227  hypothetical protein  56.01 
 
 		 996 aa  729    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.640032  normal  0.507723 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0705  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 847 aa  1688    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.63202e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0694  conserved repeat domain protein  97.33 
 
 		 848 aa  1091    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0143238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0581  conserved repeat domain protein  43.31 
 
 		 880 aa  660    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0366  chromosome segregation ATPase-like protein  62.8 
 
 		 1030 aa  761    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.641713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3278  hypothetical protein  56.13 
 
 		 966 aa  707    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1012  hypothetical protein  34.36 
 
 		 432 aa  101  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217202  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.47 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  24.09 
 
 		 615 aa  60.1  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  38.53 
 
 		 2821 aa  57.4  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  40 
 
 		 258 aa  57  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  40 
 
 		 258 aa  57  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  38.33 
 
 		 269 aa  54.3  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0936  hypothetical protein  44.54 
 
 		 801 aa  53.5  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  38.33 
 
 		 272 aa  52.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  37.1 
 
 		 269 aa  51.2  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  37.1 
 
 		 269 aa  51.2  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  37.1 
 
 		 269 aa  51.2  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  25.15 
 
 		 898 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28140  hypothetical protein  40.22 
 
 		 539 aa  49.7  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  39.62 
 
 		 264 aa  48.9  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 302 aa  47.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  39 
 
 		 643 aa  47.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  25 
 
 		 304 aa  45.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2502  hypothetical protein  31.93 
 
 		 303 aa  45.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.71 
 
 		 491 aa  44.7  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>