82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4107 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4107  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
256 aa  520  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0713  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.55 
 
 
300 aa  132  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0688  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.63 
 
 
309 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0821  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.86 
 
 
306 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308895  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.39 
 
 
303 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.68 
 
 
311 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5584  putative metapyrocatechase (MPC) (CatO2ase) (catechol 2,3- dioxygenase)  35.47 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  0.332055 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3415  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.29 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259566  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2931  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.56 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3240  hypothetical protein  50.91 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4048  hypothetical protein  51.56 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3933  hypothetical protein  67.44 
 
 
144 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.638367  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5803  hypothetical protein  67.44 
 
 
146 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573261  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1350  hypothetical protein  67.44 
 
 
144 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473408  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5279  hypothetical protein  62.79 
 
 
178 aa  62  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.40755  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1338  hypothetical protein  62.79 
 
 
171 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839117  hitchhiker  0.00972358 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4397  hypothetical protein  65.12 
 
 
144 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181293  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5315  hypothetical protein  65.12 
 
 
144 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153696  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1922  hypothetical protein  60.87 
 
 
141 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.017963 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4500  hypothetical protein  65.12 
 
 
146 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281814  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3869  hypothetical protein  65.12 
 
 
146 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.49105  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1756  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.22 
 
 
305 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2934  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.29 
 
 
295 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.38 
 
 
201 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.38 
 
 
204 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.281044  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3467  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  26.44 
 
 
326 aa  56.2  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2543  hypothetical protein  40 
 
 
127 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2506  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.33 
 
 
326 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445473  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3592  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  27.84 
 
 
325 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.318937  normal  0.834201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1680  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.66 
 
 
301 aa  52.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1113  putative dioxygenase  27.69 
 
 
309 aa  52  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1705  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  26.83 
 
 
325 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.159333  normal  0.870304 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1033  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.7 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0380289  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4442  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.71 
 
 
326 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.266673 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3865  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4282  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.61 
 
 
306 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.594556  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0444  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.38 
 
 
320 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.399259  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5600  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.53 
 
 
320 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0155074  normal  0.617624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2681  catechol 2,3 dioxygenase  27.78 
 
 
332 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0886015 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0340  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  27.22 
 
 
328 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4700  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.53 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0184772  normal  0.15123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0614  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3667  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.53 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.789956  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  51.22 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20010  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  29.63 
 
 
388 aa  47.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4677  catechol 2,3-dioxygenase  28.32 
 
 
320 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3554  2,3-dihydroxy-p-cumate-3,4-dioxygenase (CmtC)  26.11 
 
 
314 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.167156  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2570  catechol 2,3-dioxygenase  26.58 
 
 
335 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.734645  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2876  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.12 
 
 
291 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0656635 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3523  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.23 
 
 
361 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0226  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.48 
 
 
306 aa  45.4  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3502  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  25.41 
 
 
327 aa  45.4  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320908 
 
 
-
 
NC_003296  RS01659  oxidoreductase protein  25.88 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5525  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.32 
 
 
299 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313604 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1474  catechol 2,3 dioxygenase  26.47 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7068  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.21 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0884954  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2896  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 
312 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.693532  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5085  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.62 
 
 
356 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0184  glyoxalase family protein  27.75 
 
 
321 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4403  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.62 
 
 
356 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583376  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2547  Biphenyl-2,3-diol 1,2-dioxygenase  25.84 
 
 
342 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3112  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.86 
 
 
327 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5775  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.62 
 
 
356 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626114  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1114  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.51 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.118393  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3544  Catechol 2,3-dioxygenase  25 
 
 
339 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0726  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.06 
 
 
374 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0199  catechol 2,3-dioxygenase  31.11 
 
 
324 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0824837  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5079  oxidoreductase  25.76 
 
 
299 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1133  catechol 2,3-dioxygenase  30.43 
 
 
327 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2413  catechol 2,3-dioxygenase  25.48 
 
 
335 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0866  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  30.34 
 
 
363 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0669494  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3684  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29 
 
 
319 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3611  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  28.12 
 
 
363 aa  42.7  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1775  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.48 
 
 
314 aa  42.7  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0882804  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1327  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32 
 
 
188 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.894491  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2314  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.53 
 
 
322 aa  42.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7428  ring-cleavage extradiol dioxygenase  31.67 
 
 
177 aa  42.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0442338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3964  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.12 
 
 
336 aa  42.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1335  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.13 
 
 
295 aa  42.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00028013 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4094  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.02 
 
 
320 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0496661  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0961  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.1 
 
 
324 aa  42  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2776  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.74 
 
 
309 aa  42  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00387931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>