14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4397 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4397  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  294  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181293  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3933  hypothetical protein  95.14 
 
 		 144 aa  254  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.638367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5803  hypothetical protein  84.93 
 
 		 146 aa  253  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3869  hypothetical protein  84.25 
 
 		 146 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.49105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4500  hypothetical protein  84.25 
 
 		 146 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1350  hypothetical protein  86.81 
 
 		 144 aa  239  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473408  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5315  hypothetical protein  86.33 
 
 		 144 aa  234  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1922  hypothetical protein  89 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.017963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1338  hypothetical protein  71.74 
 
 		 171 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839117  hitchhiker  0.00972358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5279  hypothetical protein  71.11 
 
 		 178 aa  151  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.40755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4048  hypothetical protein  59.09 
 
 		 144 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3240  hypothetical protein  45.65 
 
 		 129 aa  103  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2543  hypothetical protein  41.07 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4107  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.12 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>